- 题目：CGM 第103期：大豆泛基因组研究
- 时间：北京时间2020年7月15日9PM（美国西部PST时间7月15日（星期三）6AM）
- 地点：Zoom and Bilibili live stream
- 主讲人：刘羽诚，2016至今，中科院遗传所，博士在读，遗传学。2012-2015，中科院植物所，硕士，理学。2008-2012，北京林业大学，学士，农学。
中文摘要
基因组是开展遗传研究的重要工具，单基因组参考的局限性催生了泛基因组的发展。大豆是世界重要的经济作物，有着丰富的表型和遗传变异，是进行泛基因组研究的理想材料。本文进行了 2,898 份大豆材料的重测序，从中选择了 26 个代表性的大豆种质材料进行了三代测序和从头组装。结合以前发表的中黄13、 W82 和 W05 基因组，深度挖掘了短读长序列比对方法未能有效检测的大尺度变异数据，并且使用图形结构方式（graph-based）组织重塑了大豆属的泛基因组。借此，本文讨论了大豆演化/驯化过程中一些重要事件及性状在泛基因组水平的变异特征。该工作进一步说明了泛基因组对于遗传变异挖掘的重要性，并且为大豆遗传育种研究提供了一套高质量，易于参考的组学数据，同时也为图形结构基因组形式在植物中的应用做出了实践。
参考文献
Yucheng Liu#, Huilong Du#, Pengcheng Li, Yanting Shen, Hua Peng, Shulin Liu, Guo-An Zhou, Haikuan Zhang, Zhi Liu, Miao Shi, Xuehui Huang, Yan Li, Min Zhang, Zheng Wang, Baoge Zhu, Bin Han, Chengzhi Liang, and Zhixi Tian. Pan-Genome of Wild and Cultivated Soybeans. Cell. 2020, 182, 1–15 (#co-first author)