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Pan-genome
2024-01-01
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学术报告
CGM 第129期: 揭示全球小麦当代育种材料的变异多样性
2020-12-23
普通小麦提供给人类的能量约占人类消耗总能量的20%。它有着异源六倍体(2n=6x=42 AABBDD)的巨大基因组(16Gb),普通六倍体小麦参考基因组的测序和组装工作在各主要作物中进展相对缓慢。国际小麦基因组测序联盟(IWGSC)用了10多年的时间(2005-2018)才组装完成并发表了面包小麦中国春的第一个染色体水平参考质量基因组及其基因注释等。近年来,随着新的基因组技术的发展,以及全球多个国……
学术报告
CGM 第40期:Towards Eukaryotic Pan-genomics
2018-10-17
一个物种所包含的所有基因的集合被称为泛基因组(pan-genome)。泛基因组研究主要关注两个方面:核心基因组(core genome)以及非必需基因组(dispensable/distributed genome)。核心基因组指的是该物种所有个体都包含的基因,表征该物种生长发育等不可或缺的功能。非必需基因组指的是仅在部分个体中存在的基因,它们与个体对外界环境的适应息息相关。自从2005年泛基因组……