学术报告

CGM 第101期：光学图谱在基因组学中的应用

2020-07-01

光学图谱作为DNA测序技术的一个重要补充，在基因组学中发挥重要的作用。在近30年的发展过程中，光学图谱已被应用到微生物以及高等动、植物的基因组研究中。大体上，光学图谱多应用于基因组组装，大范围结构变异挖掘以及菌株区分。随着技术的进一步发展，以及算法的不断提升，光学图谱的应用仍具有重要前景。在此次报告中，我将与大家分享如何利用光学图谱来提升基因组学相关研究吧。

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CGM 第99期：微生物组数据分析与可视化

2020-06-17

近年来高通量测序技术的发展，开发一系列适合微生物组研究的技术，快速推动了微生物组领域的发展并积累了海量数据。而微生物组数据分析过程复杂、软件和方法的种类多样让初涉本领域的同行非常茫然。本次演讲系统概述了微生物组常用测序技术-扩增子、宏基因组等方法的优缺点，方便同行根据科学问题快速选择合适的研究手段。同时在众种的分析软件中，挑选主流软件整合的分析流程推荐给同行，方便快速实现较优的扩增子和宏基因组分……

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CGM 第98期：Fhb7的水平转移塑造小麦赤霉病抗性

2020-06-10

小麦赤霉病是由禾谷镰刀菌引起的全球性重大真菌病害，不但可以造成减产，而且病原菌分泌的呕吐毒素严重威胁人类食品健康。遗憾的是小麦种质资源中有效抗源极其稀少。本文首先组装了小麦重要近缘种二倍体长穗偃麦草基因组，并利用该参考基因组图位克隆了主效抗赤霉病基因Fhb7。发现其编码谷胱甘肽转移酶，可以在DON及其他单端孢霉烯族毒素C13上催化加合一个谷胱甘肽，起到广谱解毒作用，也因此可以针对镰刀菌属病原菌起……

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CGM 第95期：杨柳科植物物种多样化的基因组基础：性染色体演化

2020-05-20

性别是生活中和生物进化历史上最引人瞩目的现象，是在性染色体上的基因控制下而产生的一系列雌雄分化的两性特征，其在雌雄异株（Dioecy）植物的生态适应性方面具有重要作用。一般认为，基因组上的性别决定区域（Sex determination region；包括性别决定基因及其连锁的其他基因）在雌雄两性的个体发育、性状分化和成功繁殖等方面至关重要，早期的科学家都认为其在进化中应相对较为保守。我们的研究……

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CGM 第94期：大数据在生物科学中的应用前景——来自人类基因组学研究的启示

2020-05-13

高通量测序技术正在深刻改变生物学研究的模式，多组学相结合的序列分析方法，正在以史无前例的速度揭示基因组、功能基因组以及表观基因组水平上的模式和细节。海量的数据为生物学研究带来了巨大的挑战，传统的分析方法和工具不再适用。因此，开发更高效的统计算法和计算工具迫在眉睫。在本期的讲座中，我将介绍大数据分析的难点，包括数据存储、并行计算、数据混杂以及结果的可视化。最后，我将展望大数据在生物学领域的前景，着重……

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CGM 第93期：现代玉米育种过程中的全基因组选择与遗传改良

2020-05-06

玉米是目前世界第一大农作物，广泛作为粮食、饲料和工业原材料。在过去几十年间，品种耐密性和种植密度的连续提升，支撑着玉米单产的成倍增长。但玉米现代育种过程中品种耐密性改良的遗传基础和选择规律尚未系统解析。本研究中，作者收集了近几十年来中国和美国不同育种时期广泛使用的350份玉米育种材料，经过多环境表型分析，发现现代玉米育种过程中，育种材料均经历了向更低穗位、更少雄穗分枝数、更紧凑叶夹角及更早开花期方……

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CGM 第92期：专题讨论：如何申请国内教职？

2020-04-29

本次活动我们将不录制视频或进行回放。欢迎大家届时在线参与。本期专题讨论，我们有幸邀请到武汉大学赵华斌教授，为大家分享国内申请教职的经验与相关政策。欢迎在公众号评论区或交流群中留言您想提问的问题，我们将在本期专题讨论中进行解答。新形势下，国内用人单位求贤若渴，特别支持年轻人的发展；青年人才计划丰富多样，总有一款适合你。此时此刻，正是青年才俊们在祖国建功立业的绝佳时机。然而，在复杂的国际形势下，国……

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CGM 第91期：芡实和金鱼藻揭示被子植物早期演化关系

2020-04-22

被子植物（Angiosperm）又称开花植物或有花植物，全世界范围内超过35万种，是人类大部分食物的来源，并为地球光合作用和碳固定做出了重要贡献。被子植物兴起于三叠纪晚期到晚白垩纪，由于强大的适应能力逐渐取代裸子植物在陆表植物中占据主导地位，同时也演化出了多个水生植物的类群，极大地影响了昆虫、两栖动物、哺乳动物、蕨类植物，以及许多其它生物类群的多样化进程，重塑了全球各大陆块主要生态系统格局。由于化……

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CGM 第89期：玉米密植高产的遗传密码

2020-04-08

密植在玉米增产过程中发挥重要作用，紧凑株型有利于玉米密植。UPA1和UPA2是控制玉米紧凑株型的两个QTL。UPA2位于一个包含B3结构域的转录因子ZmRAVL1上游9.5kb处，受核酸序列上2-bp插入缺失控制。DRL1结合在UPA2处，并且与来自大刍草和玉米中UPA2等位基因的结合能力不同。DRL1与LG1在物理上直接互作并抑制LG1对ZmRAVL1的转录激活作用。UPA1的功能基因……

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CGM 第88期：从历史演化角度分析水稻杂种优势构建的遗传机制

2020-04-01

我国有超过60%人口以水稻(Oryza sativa L.)为主食。杂交水稻贡献我国约58%水稻总产，因此了解杂交水稻杂种优势形成遗传规律将有助于提高杂交水稻单产，对保障我国粮食安全具有重要意义。目前通过基因组分析虽已定位到大量杂交水稻杂种优势QTLs，然而，育种家如何利用水稻种质培育杂交水稻，目前尚不清楚。本研究利用目前商用两系杂交稻亲本构建的包含2000个组合的杂交群体，结合目前已重测序……

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