学术报告

CGM 第165期生物钟中的表观遗传学和转录组学

2021-06-23

为了适应地球自转引起的每天的环境变化（例如光照和温度），各类生物进化一种保守性的生物钟。这些生物钟存在于几乎每个细胞中。但是生物钟对周边组织代谢的调控和外在的环境对生物钟的影响仍然是领域的热点问题。这次讲座，主讲人将从表观遗传学和转录组学的角度来回答这些问题。

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CGM 第163期: 利用Bionano单分子成像技术实现对人类 DNA 复制的全基因组研究

2021-06-16

DNA复制受复制起始的位置和时间调节，人们在识别和分析人类复制起始位点方面投入了大量精力。然而，真核复制动力学的异质性和后生动物个体起始位点复制起始效率低，使得绘制人类细胞复制起始的位置和时间变得困难。人类复制作图问题的一个潜在解决方案是单分子分析，但当前的方法却不能提供全基因组实验所需的通量。为了应对这一挑战，我们开发了光学复制图谱技术 (ORM)，这是一种高通量单分子方法，……

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CGM 第164期: How a tree became a crop: genomic insights into the origin, domestication and genetic basis of architecture of castor bean

2021-06-16

蓖麻（Ricinus communis）是世界重要的非食用油料作物之一，具有非常久远的使用历史，可追溯到史前时代。蓖麻种子富含蓖麻油酸，在高温下不易挥发、低温下不易凝固，一直是工业、航空和机械常用的高级润滑油，也是重要的生物柴油原料，具有重要的经济价值。而且蓖麻适应性强、种植范围广，近年来利用蓖麻发展生物柴油已在多个国家形成了商业化。但目前世界蓖麻品种单一，遗传多样性低，严重阻碍了高产优质蓖麻的……

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CGM 第162期: 新型 CRISPR/Cas13 RNA 编辑系统的挖掘与改造

2021-06-09

CRISPR/Cas13被广泛地应用于RNA单碱基编辑和核酸检测领域（比如新冠病毒检测），之前发现的Cas13系统都是从可培养的微生物基因组数据中挖掘的，然而自然界中90%的微生物都不可培养。本研究通过精巧的计算生物学算法和实验设计，对不可培养的微生物大规模宏基因组数据进行计算分析，鉴定到了两个新的Cas13家族，并命名为Cas13X和Cas13Y。最后, 通过一系列工程化改造开发了一套高效率……

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CGM 第159期: 苎麻基因组演化特征及纤维性状驯化改良

2021-06-02

报告亮点： 1. 基因组和变异组分析解析苎麻基因组演化特征 2. 结合纤维性状基因的挖掘，探究苎麻驯化过程中纤维性状选择印迹。报告简介: 苎麻是我国特有的纤维作物，在我国已有数千年的种植历史。此外，苎麻嫩茎叶粗蛋白含量高（~20%），且具有生物产量大、可多茬收割等优点，近年来在我国南方地区也被用作优质饲草作物；但苎麻作为饲草，其纤维含量过高会显著影响其饲草加工和动物采食性能。因此，解析苎麻纤维形……

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CGM 第161期: 通过空间转录组学和原位测序研究阿尔茨海默氏病

2021-06-02

以最新的前沿技术探讨类淀粉乙型蛋白在阿兹海默症中扮演的角色，我们假设类淀粉蛋白仅仅是疾病的启动者并非是最终的驱动者，类淀粉蛋白的沉积会引发多细胞协同的病理机制，而此机制最终可独立于蛋白沉积而存在，因此即便在晚期移除蛋白沉积，细胞的病变仍旧驱动疾病的进程。此研究结果找出由类淀粉蛋白沉积所引发的多细胞共组病理机制，此机制由57基因组成，代表着补体系统的活化、溶解酶失调以及氧化压力的反应。这项研究结果第……

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CGM 第158期: 有丝分裂后神经细胞内的DNA损伤和修复

2021-05-26

神经细胞是人体内寿命最长的有丝分裂后体细胞，它们不进行DNA复制，只能依靠DNA修复机制来维持基因组保真度。这些修复机制随着年龄的增长而下降，可以导致基因组功能受损，引起认知能力下降和神经退行性疾病。然而目前对于神经细胞的基因组不稳定性以及是如何进行修复的知识仍然非常有限。我们开发了两个高通量测序技术SAR-seq和ddN S1-END-seq来对神经细胞的内源性DNA损伤及修复过程进行检测，来……

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CGM 第156期: 棉花基因组和泛基因组研究纤维驯化和改良的遗传基础

2021-05-19

报告亮点： 1. 棉花变异组和泛基因组剖析棉花驯化和选择中丢失的序列和基因。 2. 基于参考基因组和染色质互作数据，试图解析棉花基因组大小的进化特征。报告简介: 棉花(Gossypium)大约52个种，共9种基因组类型，包括二倍体基因组A-G、K和四倍体AD。二倍体棉种染色体数目一致，但基因组大小差异达三倍以上，最大的二倍体基因组K比四倍体基因组AD更大。四倍体陆地棉 (G. hirsutum)……

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CGM 第157期: 肠道菌群与心血管健康

2021-05-19

心血管等代谢性疾病影响超20%全球人口，其引起的心、脑、肾和血管等损伤严重危害患者生活质量。作为复杂性疾病中的重要类别之一，早期对影响心血管健康因素的研究主要集中在遗传方面，即染色体特定位点遗传变异是否与心血管病发病风险相关，从而开发靶向遗传缺陷的药物以缓解病症。而基于大型人群队列研究发现人体遗传变异对心血管病的贡献率普遍低于10%，意味着仍有其他因素在心血管健康中起重要角色。除自身遗传因素外，近……

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CGM 第154期: 单细胞RNA组原位测序技术

2021-05-05

介绍原位测序技术，以及其与目前获得广泛应用的单细胞测序如何互补，将位于组织中的不同细胞进行细胞类型及亚型归类。近年来，单细胞测序获得广泛的应用，以期利用细胞相关信息更深入了解复杂生演讲摘要物体。但是单细胞技术要求单个细胞的分离，于是丢失了细胞原来所在位置信息。相反，原位测序在组织原位上对RNA分子进行分析，能保有原来的位置信息。……

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