学术报告

CGM 第186期专题讨论会——北美学术界求职分享

2021-09-29

当在学术的道路上披荆斩棘，在经历过 PhD 和 Postdoc 的漫长修炼后，你是否想出山，去学术的江湖里闯一闯，以挣一方立足之地？比如，找一个 tenure-track 的 faculty 位置，建立自己的研究团队，又或者找一个长期的 research scientist 位置，和不同的团队合作研究？然而，现实生活并不是想象中博士–博后–拿到教职–走上人生巅……

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CGM 第184期:一个摩擦禾来源的大片段存在缺失变异在玉米驯化及适应过程中的动态演化

2021-09-22

个人简历：https://sdws1983.github.io/cv/ […] 遗传变异的规模可从单碱基对到大的染色体事件，其中PAV作为遗传变异的一种特殊形式，特指一段序列在某些个体中存在但在某些个体中缺失。与小尺寸片段PAV相比，大片段PAV会带来基因组的不稳定性，可能导致它们无法被传递到后代。现阶段的研究已经证明，在几种多倍体作物中，基因组的多倍化和随后的分离过程均促进了大片……

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CGM 第183期: 开花与花开——模式植物和大田作物中有应用前景的基础研究

2021-09-15

“一庭春雨瓢儿菜，满架秋风扁豆花”是郑板桥的诗句，朱杨研究员带领的植物遗传和作物改良研究室，即 Plant epi-genomics and Crop improvement (PegaXi, 沛阁希) Lab，主要利用多维组学、分子生物学和基因编辑等方法研究植物和作物的开花时间、花序发育和地上部分株型建成的分子机制，以此来精准设计作物关键性状，实现提升作物适应性、产量和品质的初衷。报告人将从自己……

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CGM 第182期: 鹦鹉染色体重洗牌与性染色体演化

2021-09-10

在超过1亿年的演化历史中，鸟类的核型保持相对稳定，只在个别类群中出现例外，比如隼类与鹦鹉。但目前关于鹦鹉染色体重排的演化过程及遗传机制我们知之甚少。为此，我们比较了四种鹦鹉（和尚鹦鹉，蓝顶亚马逊鹦鹉，虎皮鹦鹉和鸮鹦鹉）染色体级别组装的基因组，并鉴定了大量染色体融合及分裂事件。这些染色体重排绝大部分是物种特异的，并且有至少12条染色体在不同鹦鹉类群独立地发生了融合。我们鉴定了两个在鹦鹉祖先特异丢失……

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CGM 第181期:两个红豆杉物种基因组为紫杉醇生物合成提供见解

2021-09-08

红豆杉是我国一级珍稀濒危保护植物，也是世界上公认的濒临灭绝的天然珍稀抗癌植物。紫杉醇是红豆杉特有的一种结构复杂的次生代谢产物，可促进微管蛋白结合，抑制癌细胞的有丝分裂，有效阻止癌细胞的增殖，被广泛应用于多种癌症的临床治疗，是目前癌症化学药物治疗的“主力军”。自紫杉醇被发现以来，科学家们经过半个多世纪的研究，完成了对其构效关系、药物剂型、药物来源、临床应用、作用机制等方面的研究。但是，迄今为止，红豆……

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CGM 第180期: 基于树结构的微生物组学研究

2021-09-01

微生物组是指生活在同一生态环境中的全体微生物。微生物组学的研究对于人类健康、公共卫生、环境保护、农业生产等都有重大意义。但是，微生物组数据的分析是一个艰难的生物信息学话题。众多的微生物成员使得数据集具有很高的维度。如果不对高维数据作进一步的结构化的区分，而把所有特征一视同仁地输入分析工具，就很难准确把握微生物组的变化规律。围绕着结构化分析这一主旨，我们创造和发展了一系列微生物组数据分析的方法、工具……

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CGM 第178期: 后生动物DNA复制终止阶段复制体的解离调控机制

2021-08-25

对于所有生物来说，DNA复制都是最为关键的生物过程。每种生物的遗传性状的维持，都依赖于其染色体准确且完整地复制。然而，个体中染色体上的所有DNA分子都必须复制一次且在细胞分裂前只能复制一次。这决定了DNA复制是一种高度复杂且被严格调控的生物过程 (O’Donnell et al., 2013) 。在真核生物中，DNA复制是一个由众多蛋白组成的超复合物来进行完成，该复合物被称作复制……

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CGM 第179期:生姜染色体水平基因组及其特有成份姜辣素的合成途径

2021-08-25

生姜是世界性药食同源辛香蔬菜之一，我国已有2000多年的栽培历史。中国生姜栽培面积、产量和出口量均居全球第一位。长江中上游生姜总面积226万亩，占全国49.7%，是推动乡村振兴的优选产业。姜辣素是生姜特有的呈味物质，也是生姜多种功能活性的主要功能因子，在调味品、化妆品和医疗保健等领域具有广阔的应用前景。然而，长久以来生姜基因组信息的缺乏，限制了我们对姜辣素合成调控机理的理解，导致生姜分子育种发展缓……

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CGM 第177期枝、刺、花：柑橘世界的“三国演义

2021-08-18

当我们出去游玩，跋山涉水的时候，难免被荆棘所刺，疼痛不已。带刺植物在自然界广泛存在，刺为植物提供了“防御武器”。刺是如何长出来的呢？在柑橘中，刺是枝的变态；枝、刺、花都是由茎分生组织分化而来。我们的研究发现，控制三者发育的关键基因相爱相杀，上演一出柑橘世界的“三国演义”。欲知详情如何，且听张飞分解！ […] F. Zhang et al. (2021).……

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CGM 第175期: Nurse cell-derived small RNAs define paternal epigenetic inheritance in Arabidopsis

2021-08-12

拟南芥雄性生殖发育过程中，生殖细胞需经历DNA甲基化重编程：除了整体DNA甲基化的变化外，局部一些位点出现生殖细胞特异的从头DNA甲基化（De novo DNA methylation），它们除了发生在转座子上，也会发生在蛋白编码基因上，从而调控转座子的活性以及基因的表达。虽然已知生殖细胞特异的从头DNA甲基化是由RdDM 途径介导的，然而，RdDM主要作用于转座子上，很少会发生在基因上。因……

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