学术报告

CGM 第122期：番茄中结构变异对基因表达和作物驯化及改良的重要影响

2020-11-11

结构变异（Structural variations）指基因组中比较大范围的变异。之前很多研究表明结构变异是作物驯化和改良相关性状的重要基础。但是，传统的短序列测序方法是鉴定结构变异的瓶颈之一。所以鉴定SV在作物中的多样性和其对基因表达和植物性状的定量影响一直具有很大的挑战性。为了全面地研究SV在番茄群体中的分布和功能，我们使用纳米孔长序列测序技术鉴定得到了100个番茄品系中的238,490……

学术报告

CGM 第103期：大豆泛基因组研究

2020-07-15

基因组是开展遗传研究的重要工具，单基因组参考的局限性催生了泛基因组的发展。大豆是世界重要的经济作物，有着丰富的表型和遗传变异，是进行泛基因组研究的理想材料。本文进行了 2,898 份大豆材料的重测序，从中选择了 26 个代表性的大豆种质材料进行了三代测序和从头组装。结合以前发表的中黄13、 W82 和 W05 基因组，深度挖掘了短读长序列比对方法未能有效检测的大尺度变异数据，并且使用图形结构方……