学术报告

CGM 第48期：水稻驯化之谜

2019-03-06

动植物的驯化奠定了农业文明的基础，也吸引了各学科学者的研究兴趣。水稻，作为最重要的粮食作物之一，也是植物遗传学领域重要的模式物种，为回答驯化的问题提供了良好的模型。目前，关于水稻起源和驯化的研究，遗传学数据得到了看似矛盾的证据，分别指向了水稻的单次或者多次起源。我们通过重新分析栽培稻和野生稻的基因组数据，发现这些矛盾证据的产生，部分原因是由于存在着大量的由栽培稻到野生稻的基因流：我们发现这种基因流……

学术报告

CGM 第47期：Environment-dependent pleiotropic effects of mutations on the maximum growth rate r and carrying capacity K of population growth

2019-02-20

r/K 选择理论是上世纪生态学和演化学上关于不同物种平衡后代数量和质量上的生存策略理论。其中，r代表最大生长速率，K代表环境对种群数量的承载能力。普遍的观点认为，r-K之间应该呈现负相关关系。然而，几十年的研究发现r-K在自然群体之间既可以正相关也可以负相关，而这一现象缺乏生物学解释。由于自然选择可以使遗传层面上负相关或者没有相关性的两个性状在个体层面表现为正相关，只有搞清楚其遗传学上的相关性才能……

学术报告

CGM 第46期：稻田杂草之首稗草与水稻相争的秘密武器

2019-02-06

稗草被认为是全球最严重的杂草之一，也是稻田杂草之首，严重影响水稻产量。化感是水稻和杂草互作的主要方式之一。长期以来，我们大多从单方向了解水稻如何与稗草进行竞争，但反过来对于稗草如何抑制水稻生长，形成竞争优势的基因组机制却知之甚少。我们对六倍体稗草（Echinochloa crus-galli）基因组进行测序获得其草图，研究发现稗草基因组中存在可以合成化感物质丁布（DIMBOA）的三个基因簇拷贝。在……

专题讨论

CGM 第45期：如何在学术会议上最大化自己的收获？

2019-01-23

作为学术新人的你，面对即将参加的学术会议，是否手足无措？是否惆怅怎样有效听取演讲，开阔学术视野？是否苦恼怎样和大牛搭讪，寻找潜在的合作和工作机会？本期CGM，我们有幸邀请到几位学术界工业界的嘉宾朋友，和您一起分享他们多年来参加学术会议的经验，如何最大化自己的收获。

人物专访

CGM 第44期：管中窥豹：以我在湖南大学工作的五年谈PI就业与发展

2018-12-19

回想自己多年前毅然决然踏上征程，来到异国他乡发展，此时的你，内心是否依然激情澎湃？面对学术界如此激烈的竞争，在留下还是回去的抉择中，在纵身跃进学术研究的海洋前，你是否也期待听到过来人的经验分享？2018年的最后一期CGM，我们隆重推出本年度的最后一个专题 — “国内PI的就业与发展”。本期活动我们邀请到了于峰博士（湖南大学教授，教育部青年长江学者，中国科协“青年人才托举工程”获得……

人物专访

CGM 第43期：生物学博士如何创业--专访投必得（TopEdit）创办人张宁博士

2018-11-28

Academia or Industry？每一个博士生应该都问过自己这样的问题。但你是否知道，除了学术界教职或工业界职位以外，自主创业也是一个可供博士们考虑的选项。本期CGM在线沙龙，我们邀请了创办了投必得公司的张宁博士与我们分享关于创业的心得体会。张宁，中国科学院植物所博士，复旦大学和美国宾州大学博后，现任美国食品药品监督管理局（FDA）研究员。博士后期间，曾主持国自然青年基金、博士后特别资助……

学术报告

CGM 第42期：Using Machine Learning to Dissect Recombination Landscape

2018-11-14

第一次减数分裂前，同源染色体会经历配对，联会和遗传物质重组交换等一系列过程。同源染色体遗传物质重组交换促进了遗传多样性的发生，进而为遗传育种及选种选育提供更多的原材料。减数分裂的重组过程是被严格调控的，它起始于DNA双链的断裂（double strand break），在RAD51及其它蛋白的作用下，DSB通过同源重组修复，一部分形成基因转换（gene conversion）个体，还有一部分形成重……

学术报告

CGM 第41期：Understanding Domestication Through Maize Mutants

2018-11-07

与高度分枝的野生祖先种相比，抑制侧生分枝被证明是高产的理想株型，因而在多种驯化作物中均受到选择。前人的研究表明从大刍草到玉米的驯化过程中可能仅有几个基因是必需的，其中之一是还原转座子驱动的teosinte branched1（tb1）转录因子过表达来实现对侧生分枝的抑制。在这里我将介绍tb1的下游靶基因tassels replace upper ears1（tru1），并展示tru1也在驯化过程中……

学术报告

CGM 第40期：Towards Eukaryotic Pan-genomics

2018-10-17

一个物种所包含的所有基因的集合被称为泛基因组（pan-genome）。泛基因组研究主要关注两个方面：核心基因组（core genome）以及非必需基因组（dispensable/distributed genome）。核心基因组指的是该物种所有个体都包含的基因，表征该物种生长发育等不可或缺的功能。非必需基因组指的是仅在部分个体中存在的基因，它们与个体对外界环境的适应息息相关。自从2005年泛基因组……

学术报告

CGM 第39期：Drought delays development of the sorghum root microbiome and enriches for monoderm bacteria

2018-10-03

近年来，植物根系微生物组研究揭示根际菌群能作物提高干旱抗性，其作用机制尚不清楚，因此对植物自身发育、干旱胁迫以及植物微生物组三者互作模式的研究是应对日益加剧的农业干旱的重要策略。我们的研究结合16S基因扩增子测序，揭示了高粱各发育时期以及干旱胁迫下根系微生物的动态变化。其中格兰氏阳性菌在干旱胁迫根系菌群中的比例显著增加。通过宏转录组和代谢组分析，我们发现干旱下植物根际的氨基酸和碳相关代谢物增加，……

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