学术报告

CGM 第169期: 合成表观遗传学：利用合成生物学解析组蛋白变体密码

2021-07-14

染色质结构和功能的动态调控网络是由多种表观遗传修饰因子协同作用完成，包括组蛋白变体、组蛋白翻译后修饰、DNA/RNA修饰、染色质重塑复合物等。这其中，随着“组蛋白变体密码”假说的提出，越来越多的研究表明组蛋白变体序列进行快速进化，赋予染色质结构和功能的多样性，完成对遗传信息的编码存储和读取表达过程，在细胞命运决定和重大疾病进展中发挥重要作用。我们通过对酵母染色体的人工改造，证实了组蛋白变……

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CGM 第170期: 人类基因组遗传总效应评估

2021-07-14

遗传多效性（Pleiotropy）是有着超过一个多世纪历史的遗传学概念【1】，描述一个DNA变异或基因同时影响多个性状的现象。近十五年，大量的全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies，GWAS）表明人类的复杂性状普遍具有“微效多基因”的遗传图谱——即受许多基因及变异的影响，而每个基因及变异对复杂性状的效应十分微小【2】。从而，基因组中大量的变异普遍具有遗传……

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CGM 第168期寄生的代价--寄生花基因丢失与水平基因转移组学分析

2021-07-07

绝大多数植物通过光合作用实现自养，而寄生植物则通过寄主获得生命所需的水和养分。寄生花是我国境内唯一的大花草科植物，仅在云南西双版纳有零星分布。大花草科约含36个物种，全部寄生于葡萄科崖爬藤属（Tetrastigma）植物，开花时散发类似于腐肉的恶臭气味吸引蝇类为其传粉。该类群植物茎、叶、根完全缺失，在开花之前仅以类似于“菌丝”的形式存在于宿主体内，却能孕育直径超过一米的艳丽花冠，代表了植物界最为极……

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CGM 第166期: 科研在欧洲--职业规划专题讨论会

2021-06-30

CGM欧洲区第九期（CGM-EU9; CGM总第166期）在线沙龙活动，将首次开启“谈论+互动”圆桌会议模式的分享。本次活动主题是“科研在欧洲 – 职业规划专题讨论”。我们特别邀请了五位重磅嘉宾（PIs）：陈春龙（法国居里研究所）、傅静远（荷兰格罗宁根大学医学中心）、刘海坤（德国国家癌症研究中心）、任婧（英国医学研究理事会分子生物学）和张国捷（丹麦哥本哈根大学）。五位嘉宾将“围着圆桌”……

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CGM 第167期: 高质量喜树基因组揭示喜树碱合成通路的进化

2021-06-30

喜树碱（Camptothecin）及其衍生物是一类被广泛用作治疗多种恶性肿瘤的单萜吲哚生物碱，是仅次于紫杉醇的第二大木本类抗肿瘤药物。1966年首次从喜树（Camptotheca acuminata）中分离出来。喜树碱通过选择性地与拓扑异构酶I结合并阻止DNA链的重新连接，从而有效抑制肿瘤细胞的增殖。由于具有较高的经济价值和药用价值，喜树碱及其衍生物的生物合成和化学合成途径也成为了近年来研究的热点……

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CGM 第165期生物钟中的表观遗传学和转录组学

2021-06-23

为了适应地球自转引起的每天的环境变化（例如光照和温度），各类生物进化一种保守性的生物钟。这些生物钟存在于几乎每个细胞中。但是生物钟对周边组织代谢的调控和外在的环境对生物钟的影响仍然是领域的热点问题。这次讲座，主讲人将从表观遗传学和转录组学的角度来回答这些问题。

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CGM 第163期: 利用Bionano单分子成像技术实现对人类 DNA 复制的全基因组研究

2021-06-16

DNA复制受复制起始的位置和时间调节，人们在识别和分析人类复制起始位点方面投入了大量精力。然而，真核复制动力学的异质性和后生动物个体起始位点复制起始效率低，使得绘制人类细胞复制起始的位置和时间变得困难。人类复制作图问题的一个潜在解决方案是单分子分析，但当前的方法却不能提供全基因组实验所需的通量。为了应对这一挑战，我们开发了光学复制图谱技术 (ORM)，这是一种高通量单分子方法，……

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CGM 第164期: How a tree became a crop: genomic insights into the origin, domestication and genetic basis of architecture of castor bean

2021-06-16

蓖麻（Ricinus communis）是世界重要的非食用油料作物之一，具有非常久远的使用历史，可追溯到史前时代。蓖麻种子富含蓖麻油酸，在高温下不易挥发、低温下不易凝固，一直是工业、航空和机械常用的高级润滑油，也是重要的生物柴油原料，具有重要的经济价值。而且蓖麻适应性强、种植范围广，近年来利用蓖麻发展生物柴油已在多个国家形成了商业化。但目前世界蓖麻品种单一，遗传多样性低，严重阻碍了高产优质蓖麻的……

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CGM 第162期: 新型 CRISPR/Cas13 RNA 编辑系统的挖掘与改造

2021-06-09

CRISPR/Cas13被广泛地应用于RNA单碱基编辑和核酸检测领域（比如新冠病毒检测），之前发现的Cas13系统都是从可培养的微生物基因组数据中挖掘的，然而自然界中90%的微生物都不可培养。本研究通过精巧的计算生物学算法和实验设计，对不可培养的微生物大规模宏基因组数据进行计算分析，鉴定到了两个新的Cas13家族，并命名为Cas13X和Cas13Y。最后, 通过一系列工程化改造开发了一套高效率……

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CGM 第159期: 苎麻基因组演化特征及纤维性状驯化改良

2021-06-02

报告亮点： 1. 基因组和变异组分析解析苎麻基因组演化特征 2. 结合纤维性状基因的挖掘，探究苎麻驯化过程中纤维性状选择印迹。报告简介: 苎麻是我国特有的纤维作物，在我国已有数千年的种植历史。此外，苎麻嫩茎叶粗蛋白含量高（~20%），且具有生物产量大、可多茬收割等优点，近年来在我国南方地区也被用作优质饲草作物；但苎麻作为饲草，其纤维含量过高会显著影响其饲草加工和动物采食性能。因此，解析苎麻纤维形……

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