学术报告

CGM 第192期食无味、涩有理: 高梁驯化中的人谷鸟

2021-10-27

民以食为天。酸甜苦辣咸，唯苦涩难以下咽。去涩是主粮驯化的关键步骤之一。单宁是植物合成的高效苦涩诱导物。驯化后，栽培水稻，玉米，小麦的种子全部成功脱“单”，只有谜一样的高梁有一半的栽培品种仍有单宁。是非洲老祖先的万年不作为，还是神秘的非洲大陆另有隐情？从美国小镇实验田的偶发事件起，我们放眼整个非洲大陆，在农业生态系统的层次探索了高粱驯化之谜。两个关键单宁调控基因，世上最多的小鸟，再到人的味觉受体，……

学术报告

CGM 第187期: 癌症早诊／早筛前沿进展和创新技术方案

2021-10-15

癌症早筛／早诊是近年来基因组学临床应用的热点。近年来，由于液体活检等技术的快速进步，研究者们开始积极探索基于新型分子检测技术的癌症早筛／早诊方法并取得了一些积极的研究成果。本次演讲将分享癌症早诊／早筛分子检测技术的前沿进展和创新技术方案。汪宇盈博士自2017年起就职于华大基因，负责癌症早筛产品管线研发，现任华大数极首席技术官（CTO）。长期从事细胞生物学和肿瘤基因组学研究，以第一作者或通讯作者身……

学术报告

CGM 第189期叶儿黄，冬将至——能量代谢系统调节植物冬季响应机制

2021-10-13

植物终生处在每天24小时白天黑暗的交替，也处在四季不同光长的更迭之中。植物是如何细数这些时间和季节的变化的呢？如何按时调控不同基因的表达来分配自身能量水平，从而来应对这些外界环境的变化的呢？通过生物信息分析，我们发现了一群冬季高表达的基因，该基因群的多数基因会在冬季夜间大量表达。进一步的研究发现这群基因整合了光周期信号和植物能量水平，在生物钟的协调下有条不紊的按时按需表达，从容应对季节变化。……

学术报告

CGM 第186期专题讨论会——北美学术界求职分享

2021-09-29

当在学术的道路上披荆斩棘，在经历过 PhD 和 Postdoc 的漫长修炼后，你是否想出山，去学术的江湖里闯一闯，以挣一方立足之地？比如，找一个 tenure-track 的 faculty 位置，建立自己的研究团队，又或者找一个长期的 research scientist 位置，和不同的团队合作研究？然而，现实生活并不是想象中博士–博后–拿到教职–走上人生巅……

学术报告

CGM 第183期: 开花与花开——模式植物和大田作物中有应用前景的基础研究

2021-09-15

“一庭春雨瓢儿菜，满架秋风扁豆花”是郑板桥的诗句，朱杨研究员带领的植物遗传和作物改良研究室，即 Plant epi-genomics and Crop improvement (PegaXi, 沛阁希) Lab，主要利用多维组学、分子生物学和基因编辑等方法研究植物和作物的开花时间、花序发育和地上部分株型建成的分子机制，以此来精准设计作物关键性状，实现提升作物适应性、产量和品质的初衷。报告人将从自己……

学术报告

CGM 第182期: 鹦鹉染色体重洗牌与性染色体演化

2021-09-10

在超过1亿年的演化历史中，鸟类的核型保持相对稳定，只在个别类群中出现例外，比如隼类与鹦鹉。但目前关于鹦鹉染色体重排的演化过程及遗传机制我们知之甚少。为此，我们比较了四种鹦鹉（和尚鹦鹉，蓝顶亚马逊鹦鹉，虎皮鹦鹉和鸮鹦鹉）染色体级别组装的基因组，并鉴定了大量染色体融合及分裂事件。这些染色体重排绝大部分是物种特异的，并且有至少12条染色体在不同鹦鹉类群独立地发生了融合。我们鉴定了两个在鹦鹉祖先特异丢失……

学术报告

CGM 第180期: 基于树结构的微生物组学研究

2021-09-01

微生物组是指生活在同一生态环境中的全体微生物。微生物组学的研究对于人类健康、公共卫生、环境保护、农业生产等都有重大意义。但是，微生物组数据的分析是一个艰难的生物信息学话题。众多的微生物成员使得数据集具有很高的维度。如果不对高维数据作进一步的结构化的区分，而把所有特征一视同仁地输入分析工具，就很难准确把握微生物组的变化规律。围绕着结构化分析这一主旨，我们创造和发展了一系列微生物组数据分析的方法、工具……

学术报告

CGM 第178期: 后生动物DNA复制终止阶段复制体的解离调控机制

2021-08-25

对于所有生物来说，DNA复制都是最为关键的生物过程。每种生物的遗传性状的维持，都依赖于其染色体准确且完整地复制。然而，个体中染色体上的所有DNA分子都必须复制一次且在细胞分裂前只能复制一次。这决定了DNA复制是一种高度复杂且被严格调控的生物过程 (O’Donnell et al., 2013) 。在真核生物中，DNA复制是一个由众多蛋白组成的超复合物来进行完成，该复合物被称作复制……

学术报告

CGM 第177期枝、刺、花：柑橘世界的“三国演义

2021-08-18

当我们出去游玩，跋山涉水的时候，难免被荆棘所刺，疼痛不已。带刺植物在自然界广泛存在，刺为植物提供了“防御武器”。刺是如何长出来的呢？在柑橘中，刺是枝的变态；枝、刺、花都是由茎分生组织分化而来。我们的研究发现，控制三者发育的关键基因相爱相杀，上演一出柑橘世界的“三国演义”。欲知详情如何，且听张飞分解！ […] F. Zhang et al. (2021).……

学术报告

CGM 第175期: Nurse cell-derived small RNAs define paternal epigenetic inheritance in Arabidopsis

2021-08-12

拟南芥雄性生殖发育过程中，生殖细胞需经历DNA甲基化重编程：除了整体DNA甲基化的变化外，局部一些位点出现生殖细胞特异的从头DNA甲基化（De novo DNA methylation），它们除了发生在转座子上，也会发生在蛋白编码基因上，从而调控转座子的活性以及基因的表达。虽然已知生殖细胞特异的从头DNA甲基化是由RdDM 途径介导的，然而，RdDM主要作用于转座子上，很少会发生在基因上。因……

1
2
3
20