学术报告

CGM 第56期：人物专访蒋宁教授：与跳跃基因共舞

2019-06-26

[…] 二十世纪中期，Barbara McClintock 在玉米中首次发现了“跳跃基因”，为人类打开了认识植物基因组的一扇全新大门，并因此获得了1983年诺贝尔生理或医学奖。我们本期的专访嘉宾——蒋宁教授，对转座子研究领域也有着突出的贡献，让我们来听听她的故事。蒋宁教授目前任职于密西根州立大学，多年来专注于转座子研究，在转座子类型鉴定、功能分析、进化方向等方面取得了诸多突破性进……

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CGM 第55期：水稻株型驯化极简史：1+3=1

2019-06-12

关键词： Parallel domestication, rice plant architecture, tandem repeats 通过改变生长习性，塑造有利株型，进而提高产量，是作物驯化过程中至关重要的一步. 利用完全匍匐生长的元江普通野生稻 (Oryza rufipogon) ，我们前期的工作表明PROG1基因的隐性变异是选择直立生长的一个重要靶点。最近，利用携带隐性prog1但半匍匐生……

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CGM 第54期：酵母菌进化模式

2019-05-29

关键词： Saccharomycotina, horizontal gene transfer, phylogenomics, reductive evolution 生物多样性是进化生物学，生态学领域研究的热点问题之一。新类群产生是由于该类群新基因的获得（gain）还是祖先基因的丢失（loss），导致它们与其他类群具有不一样的性状？酵母菌亚门是一类古老的真菌微生物，包含酿酒发面的酵……

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CGM 第53期：人工智能在抗体中的应用

2019-05-15

The antibody, an important part of the immune system, is a widely used reagent of biomedical experiments. Misuse of antibodies, often due to insufficient data, are responsible for up to 50% of failed……

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CGM 第52期：Genome-resolved metagenomics 解码宏基因组

2019-05-01

微生物的物种和功能多样性是微生物学研究的主旨，微生物的分离培养技术为我们在这两个方面的认识奠定了坚实的基础。然而，绝大部分的微生物是不可培养的，这极大地限制了微生物学研究的进展，同时也催生了多种基于免培养的微生物研究方法，宏基因组学即是其中之一。Genome-resolved metagenomics 是以获得微生物基因组 (Metagenome-assembled genomes, MAGs)，……

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CGM 第51期：计算机视觉及三维算法设计在植物表型测量中的应用

2019-04-17

检测植物的生长以及形态需要在三维坐标空间里引入智能化的测量工具。测量结果的分析以及建立植物表型和基因的联系更需要借助于大规模的计算机辅助测量工具。我的研究工作侧重于，如何将目前的计算机视觉及三维算法设计技术应用于植物表型的测量和基因的分析。报告中将会展示2套软件及硬件系统，包含玉米根部表型三维重建及分析软件和硬件平台，和二维植物生长测量软件平台。软件部分均为开源代码，希望大家多提宝贵意见和建议。……

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