学术报告

CGM 第42期：Using Machine Learning to Dissect Recombination Landscape

2018-11-14
Thumbnail
第一次减数分裂前，同源染色体会经历配对，联会和遗传物质重组交换等一系列过程。同源染色体遗传物质重组交换促进了遗传多样性的发生，进而为遗传育种及选种选育提供更多的原材料。减数分裂的重组过程是被严格调控的，它起始于DNA双链的断裂（double strand break），在RAD51及其它蛋白的作用下，DSB通过同源重组修复，一部分形成基因转换（gene conversion）个体，还有一部分形成重……
学术报告

CGM 第41期：Understanding Domestication Through Maize Mutants

2018-11-07
Thumbnail
与高度分枝的野生祖先种相比，抑制侧生分枝被证明是高产的理想株型，因而在多种驯化作物中均受到选择。前人的研究表明从大刍草到玉米的驯化过程中可能仅有几个基因是必需的，其中之一是还原转座子驱动的teosinte branched1（tb1）转录因子过表达来实现对侧生分枝的抑制。在这里我将介绍tb1的下游靶基因tassels replace upper ears1（tru1），并展示tru1也在驯化过程中……
学术报告

CGM 第40期：Towards Eukaryotic Pan-genomics

2018-10-17
Thumbnail
一个物种所包含的所有基因的集合被称为泛基因组（pan-genome）。泛基因组研究主要关注两个方面：核心基因组（core genome）以及非必需基因组（dispensable/distributed genome）。核心基因组指的是该物种所有个体都包含的基因，表征该物种生长发育等不可或缺的功能。非必需基因组指的是仅在部分个体中存在的基因，它们与个体对外界环境的适应息息相关。自从2005年泛基因组……
学术报告

CGM 第39期：Drought delays development of the sorghum root microbiome and enriches for monoderm bacteria

2018-10-03
Thumbnail
近年来，植物根系微生物组研究揭示根际菌群能作物提高干旱抗性，其作用机制尚不清楚，因此对植物自身发育、干旱胁迫以及植物微生物组三者互作模式的研究是应对日益加剧的农业干旱的重要策略。 我们的研究结合16S基因扩增子测序，揭示了高粱各发育时期以及干旱胁迫下根系微生物的动态变化。其中格兰氏阳性菌在干旱胁迫根系菌群中的比例显著增加。通过宏转录组和代谢组分析，我们发现干旱下植物根际的氨基酸和碳相关代谢物增加，……