学术报告

CGM 第 182 期: 鹦鹉染色体重洗牌与性染色体演化

2021-09-10

在超过 1 亿年的演化历史中，鸟类的核型保持相对稳定，只在个别类群中出现例外，比如隼类与鹦鹉。但目前关于鹦鹉染色体重排的演化过程及遗传机制我们知之甚少。为此，我们比较了四种鹦鹉（和尚鹦鹉，蓝顶亚马逊鹦鹉，虎皮鹦鹉和鸮鹦鹉）染色体级别组装的基因组，并鉴定了大量染色体融合及分裂事件。这些染色体重排绝大部分是物种特异的，并且有至少 12 条染色体在不同鹦鹉类群独立地发生了融合。我们鉴定了两个在鹦鹉祖先特异丢失……

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CGM 第 181 期: 两个红豆杉物种基因组为紫杉醇生物合成提供见解

2021-09-08

红豆杉是我国一级珍稀濒危保护植物，也是世界上公认的濒临灭绝的天然珍稀抗癌植物。紫杉醇是红豆杉特有的一种结构复杂的次生代谢产物，可促进微管蛋白结合，抑制癌细胞的有丝分裂，有效阻止癌细胞的增殖，被广泛应用于多种癌症的临床治疗，是目前癌症化学药物治疗的 “主力军”。自紫杉醇被发现以来，科学家们经过半个多世纪的研究，完成了对其构效关系、药物剂型、药物来源、临床应用、作用机制等方面的研究。但是，迄今为止，红豆……

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CGM 第 180 期: 基于树结构的微生物组学研究

2021-09-01

微生物组是指生活在同一生态环境中的全体微生物。微生物组学的研究对于人类健康、公共卫生、环境保护、农业生产等都有重大意义。但是，微生物组数据的分析是一个艰难的生物信息学话题。众多的微生物成员使得数据集具有很高的维度。如果不对高维数据作进一步的结构化的区分，而把所有特征一视同仁地输入分析工具，就很难准确把握微生物组的变化规律。围绕着结构化分析这一主旨，我们创造和发展了一系列微生物组数据分析的方法、工具……

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CGM 第 178 期: 后生动物 DNA 复制终止阶段复制体的解离调控机制

2021-08-25

对于所有生物来说，DNA 复制都是最为关键的生物过程。每种生物的遗传性状的维持，都依赖于其染色体准确且完整地复制。然而，个体中染色体上的所有 DNA 分子都必须复制一次且在细胞分裂前只能复制一次。这决定了 DNA 复制是一种高度复杂且被严格调控的生物过程 (O’Donnell et al., 2013) 。在真核生物中，DNA 复制是一个由众多蛋白组成的超复合物来进行完成，该复合物被称作复制……

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CGM 第 179 期: 生姜染色体水平基因组及其特有成份姜辣素的合成途径

2021-08-25

生姜是世界性药食同源辛香蔬菜之一，我国已有 2000 多年的栽培历史。中国生姜栽培面积、产量和出口量均居全球第一位。长江中上游生姜总面积 226 万亩，占全国 49.7%，是推动乡村振兴的优选产业。姜辣素是生姜特有的呈味物质，也是生姜多种功能活性的主要功能因子，在调味品、化妆品和医疗保健等领域具有广阔的应用前景。然而，长久以来生姜基因组信息的缺乏，限制了我们对姜辣素合成调控机理的理解，导致生姜分子育种发展缓……

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CGM 第 177 期枝、刺、花：柑橘世界的 “三国演义

2021-08-18

当我们出去游玩，跋山涉水的时候，难免被荆棘所刺，疼痛不已。带刺植物在自然界广泛存在，刺为植物提供了 “防御武器”。刺是如何长出来的呢？在柑橘中，刺是枝的变态；枝、刺、花都是由茎分生组织分化而来。我们的研究发现，控制三者发育的关键基因相爱相杀，上演一出柑橘世界的 “三国演义”。欲知详情如何，且听张飞分解！ […] F. Zhang et al. (2021).……

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CGM 第 175 期: Nurse cell-derived small RNAs define paternal epigenetic inheritance in Arabidopsis

CGM 第 175 期: Nurse cell-derived small RNAs define paternal epigenetic inheritance in Arabidopsis

2021-08-12

拟南芥雄性生殖发育过程中，生殖细胞需经历 DNA 甲基化重编程：除了整体 DNA 甲基化的变化外，局部一些位点出现生殖细胞特异的从头 DNA 甲基化（De novo DNA methylation），它们除了发生在转座子上，也会发生在蛋白编码基因上，从而调控转座子的活性以及基因的表达。虽然已知生殖细胞特异的从头 DNA 甲基化是由 RdDM 途径介导的，然而，RdDM 主要作用于转座子上，很少会发生在基因上。因……

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CGM 第 176 期: 买麻藤类植物——百岁兰的适应性进化

2021-08-11

种子植物（Spermatophyta）是现今地球表面上绿色的主体，是植物界最为进化的种群。依据种子是否有果皮包裹，人们将超过 40 余万种种子植物分为裸子植物和被子植物，根据系 > 统演化关系，进一步将其分为五条相对孤立的传代线：苏铁类、银杏类、松柏类、买麻藤类以及被子植物。本课题组长期关注买麻藤类植物的系统演化、生态适应及传粉生物学特征等方面，利用比较基因组学、分子生物学、细胞生物学等学科交叉研……

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CGM 第 174 期: 无膜细胞器——液液相分离在植物免疫中的调控作用

2021-08-04

细胞是生命体的基本结构，为个体生存提供物质保障。然而细胞内的环境是非常拥堵的。为了行使正常的活动，细胞通过生物膜包裹的细胞器分隔胞内的环境和各种生化反应。然而并不是所有的细胞活动都是膜介导的。细胞生物学领域的一个新兴方向发现细胞可以通过液液相分离形成 “无膜细胞器”，而对他们的功能性研究才刚刚开始。通过生物信息学、分子生物学、细胞生物学、生物化学以及结构生物学研究，我们筛选出了一个新的植物免疫……

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CGM 第 172 期: 细胞表面和胞内受体相互促进增强植物免疫力

2021-07-28

The plant immune system involves cell-surface receptors that detect intercellular pathogen-derived molecules, and intracellular receptors that activate immunity upon detection of pathogen-secreted……

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