- 题目：CGM 第153期: 三维基因组学的技术实现与应用研究
- 时间：美国中部时间 2021年04月28日（星期三）8PM（北京时间04月29日 星期四 9AM）
- 地点：Zoom and YouTube live stream
- 主讲人：刘涵博士，2008年于北京林业大学获理学学士学位；2011年和2016年于中国农业大学分别获农学硕士、农学博士学位。博士后。2019年4月入职中科院植物所。前期工作以共同一作发表于Nature Comm与BMC Plant Biology。长期致力于植物三维基因组学研究，独立在国内创建并发表ChIA-PET、HiChIP、improved 4C-seq等。发明新型的Genotyping-By-Sequencing与CUT&Tag方法。对基因组中的远程调控元件如enhancer与super-enhancer的起源、结构与功能，对单细胞多组学水平的发育轨迹、相变产生与作用、TF-motif、染色质外环状DNA及RNA介导的3D互作等兴趣浓厚。另外的兴趣是，根据待研究的具体科学问题，有针对性地开发新颖的技术方法。
中文摘要
介绍3D基因组学的研究对象、研究方法，及其在动植物上的应用。介绍3D视角下的生理、病理与进化上的研究进展，特别是以（超级）增强子互作与癌症产生的关联的新颖现象。由于演讲人长期研究植物（玉米），因此也将介绍调控具体农艺性状的基因在营养组织与生殖组织中的互作异同，及在大刍草驯化为现代玉米过程中的3D结构变异。
参考文献
En Li*, Han Liu*, Liangliang Huang, Xiangbo Zhang, Xiaomei Dong, Weibin Song, Haiming Zhao, Jinsheng Lai, Long-range interactions between proximal and distal regulatory regions in maize, Nature Communications, 2019
Baobao Wang*, Han Liu*, Zhipeng Liu*, Xiaomei Dong, Jinjie Guo, Wei Li, Jing Chen, Chi Gao, Yanbin Zhu, Xinmei Zheng, Zongliang Chen, Jian Chen, Weibin Song, Andrew Hauck and Jinsheng Lai, Identification of minor effect QTLs for plant architecture related traits using super high density genotyping and large recombinant inbred population in maize (Zea mays), BMC Plant Biology (2018) 18:17
Zongliang Chen, BaobaoWang, Xiaomei Dong, Han Liu, Longhui Ren, Jian Chen, Andrew Hauck, Weibin Song and Jinsheng Lai，An ultra-high density bin-map for rapid QTL mapping for tassel and ear architecture in a large F2 maize population. BMC Genomics 2014, 15:433