学术报告

CGM 第27期：Host genetic control of symbiosis specificity in Medicago truncatula

2018-04-18

在根瘤菌与豆科植物的共生关系中，根瘤菌以类菌体（bacteroid）的形式存在于根瘤中，并进行固氮作用（nitrogen fixation）为植物提供氮源。以共生固氮作为豆科植物之生物氮肥，可以提高豆科植物的产量，并可减少因过量使用化学肥料造成对土壤环境的破坏。然而，植物与根瘤菌的共生互作具有一定的特异性，即特定种类或基因型的豆科植物只能与某些种属或基因型的根瘤菌形成具有固氮功能的根瘤。那么作为寄……

学术报告

CGM 第25期：Profiling of Short-Tandem-Repeat Disease Alleles in 12,632 Human Genomes

2018-03-21

Profiling of Short-Tandem-Repeat Disease Alleles in 12,632 Human Genomes 短串联重复序列（STR）由于其多态性，在遗传图谱分析、家系鉴定、身份认证和群体遗传学有广泛应用。部分STR位点长度的突变导致了多种遗传病，包括亨廷顿舞蹈病、Fragile X和遗传性共济失调SCA等。由于其短读长，通过二代测序鉴定STR位点目前存在很多挑……

学术报告

CGM 第24期：Genome Plasticity of Wheat

2018-03-07

Genome Plasticity of Wheat 小麦大约一万年前起源于中东的新月沃土（Fertile Crescent）地区，现在已经在世界各地广泛种植，成为了继玉米、水稻之后的第三大作物。小麦的这种超强适应性源于其异源多倍体的基因组。普通小麦是个新形成的异源多倍体，其基因组进行着非常快的变化，主要是转座引子引起的基因删除和破坏。由于普通小麦三个亚基因组很相近，很多基因都有两个到三个拷贝，所……

学术报告

CGM 第23期：Polyploidy and duplicated gene regulation, stories of cotton 棉花进化那些事儿

2018-02-21

Polyploidy and duplicated gene regulation, stories of cotton 棉花进化那些事儿多倍化这一现象在整个真核生物中普遍存在，尤其是在植物的物种形成及其随后的进化过程发挥了关键的作用。在细胞内，遗传物质的加倍在不同程度上影响着基因表达调控的各个环节，进而推动了生物功能以及表观形态的选择进化历程。我的研究工作是通过功能基因组学，以棉属植……

学术报告

CGM 第22期：Quantitative disease resistance in maize

2018-02-07

Quantitative disease resistance in maize 提高玉米抗病性是玉米育种的永恒目标之一。玉米的病害种类多、分布广、危害重、变化快，新老病害的蔓延此起彼伏，造成严重的损失。解析抗病性遗传基础，利用分子标记辅助选择聚合多个优良的抗病等位基因，将加速培育具有持久抗性的玉米品种。与水稻、小麦等其他禾谷类作物不同，玉米育种中利用的抗性主要是数量抗性。作为一个天然的异化授粉作……

学术报告

CGM 第21期：油菜素类内酯调节狗尾巴草分生组织特性及其特有花序结构的分化

2018-01-24

油菜素类内酯（BRs）调节狗尾巴草（Setaria viridis）分生组织特性及其特有花序结构的分化花序结构是作物产量潜力的决定因素，并受侧生生分生组织的排列组成和其发育命运的影响。谷物的小穗是决定花序形态的重要结构。小穗在最后一轮侧生分生组织形成之后开始分化，并在其中着生花朵最终形成籽粒。在狗尾草属中，花序分枝最终可以形成小穗或刚毛（bristle）两种不同的花序结构，并且这两种结构似乎是成……

学术报告

CGM 第20期：Population Genetics of Grape Domestication

2017-12-20

群体遗传学已经被广泛的应用于研究一年生作物的驯化,但我们对多年生植物的驯化知之甚少。葡萄(Vitis vinifera spp. vinifera)是世界上最重要的经济作物, 应用全基因组数据和群体遗传学方法,我们首次对葡萄的植物驯化进行了深入分析,从某种程度上解决了植物驯化方面的三大悬疑:第一,驯化的时间尺度:所有的考古证据表明驯化发生在成千上万年前,但遗传证据表明它可以快速发生。我们……

学术报告

CGM 第19期：All roads lead to weediness: stories about weedy rice origins and weedy genes

2017-11-22

杂草稻是一类草本稻属的植物，广泛存在于全世界各地的水稻田。因其强大的竞争性，对栽培稻的产量形成了很大的威胁。长期以来，开展杂草研究的科学家用落粒性和红色种皮作为定义杂草稻的主要性状。从进化生物学的角度来看，因其在不同地理位置的独立起源和多种祖先，杂草稻也是绝佳的研究平行进化的生物系统。在南亚这样一块野生稻祖先和多种栽培稻品种共生的土地，杂草稻又有怎样的起源呢？我的报告将从群体遗传的角度，讨论南亚……

学术报告

CGM 第18期：OSG101：基于高通量计算平台的生物数据分析

2017-11-08

随着生物数据类型和数量的快速增长，数据分析在生命科学研究中的重要性日益增加。越来越多的生物课题开始结合“大数据”和“高计算”的概念，从海量数据中寻找具有稳定性和普适性的生物发现。然而随之产生的计算成本也逐渐成为目前阻碍学科发展的众多瓶颈之一。在这一期在线沙龙活动中，我将为大家介绍一个高通量计算的平台，Open Science Grid（OSG）。可能在生物领域里，OSG的名字还很陌生。不过大家可能……

学术报告

CGM 第17期：The Evolution of Maize during Post-Domestication Expansion across Americas

2017-10-25

玉米在墨西哥南部湿热河谷地区驯化后迅速占领了美洲从热带到温带，从低海拔到高海拔的大面积区域。在这个迁移过程中，玉米的种植面积在不断扩大，而它的有效群体大小又是如何波动的呢？墨西哥中部高原区的玉米品系接受了同域分布的野生玉米的基因流以帮助它适应高海拔的生境。这种适应性的基因渐渗是否也发生在其他的不同域分布的玉米群体中呢？是否存在“驯化的代价”，“迁移的代价”（有害突变随着驯化和迁移而增加）？基因渐渗……

1
2
3
19
20
21
22