学术报告

CGM 第10期：Unbiased k-mer Analysis for Comparative Genomics

2017-07-19

基因组的不同决定了大多数生物表型特征的差异。众多旨在寻找决定表型的基因类型（基因序列）的生物研究课题，让我们认识到，除了准确地定性或定量检测生物个体表型特征之外，我们还必须能够有效地分析不同个体之间基因组序列的差异。目前，比较基因组方法大多依赖于参考基因组。采用单一的参考基因组存在许多问题，例如，基因组序列代表性不够，在复杂多态性位点很难有效进行序列比对，无法有效地分析重复序列，等等。我们今天要讨……

学术报告

CGM 第9期：The cause and consequence of alternative splicing in maize and across species

2017-07-05

人类基因组只有两万个基因，但这两万个基因组成了复杂的核糖核酸和蛋白网络，在这个过程中一个基因往往能够产生很多个核糖核酸或者蛋白质，在果蝇中某个基因可以产生几万个核糖核酸或者蛋白质。这个由一个基因组通过基因内结构的重组产生不同的核糖核酸或者蛋白质的方式叫做可变剪切。很多神经方面的疾病都会造成可变剪切的变异，比如说自闭症，脊髓性肌萎缩，早衰症，各类肌肉萎缩疾病等等。在植物研究当中发育和对环境的适应……

学术报告

CGM 第7期：Rapidly define crop gene functions using Setaria viridis as a model

2017-05-24

在今天人口爆炸而资源有限的大背景下，通过植物遗传学的手段来改进我们的粮食和能源作物使之获得更大的产量，同时消耗更少的资源是一种重要的解决此矛盾的途径。可是迄今为止，即使在重要传统农作物中，遗传学研究依然进展缓慢。以玉米(Zea mays)为例，作为产量最大的农作物以及传承自上世纪20年代的经典遗传学模式作物，我们也才仅仅对于其六万多个基因中的约五百个的功能有大致的了解。此项研究中我们展示了一个可……

学术报告

CGM 第5期：白菜的前世今生

2017-04-26

白菜，不仅是一种我们从小吃到大的蔬菜，还是《功夫厨神》中的开水白菜，是植物大战僵尸中的拳击战士。说到白菜，想必大家心中都有一个以其为原料烧制的菜肴，让人感到家的味道与温暖。这期沙龙我们就来聊一聊白菜不同亚种的起源和它们的传播，看看它们如何从地中海北部传播到世界各地。如果有兴趣也可以看一下我们发表在Molecular Ecology的文章。

学术报告

CGM 第4期：Comparative genomics approaches accurately predict deleterious variants in plants

2017-04-12

您想知道您的基因组上有多少导致疾病的突变吗？您想知道您研究的对象基因组上有多少降低产量或者适应性的突变吗？我们为您准备了一个贴心的pipeline叫BAD-Mutation, 帮您预测一切有害的突变。若有兴趣，请加入本期的讨论会。作者将向您详细介绍BAD-Mutation的优点及其教您怎样使用BAD-Mutation。若有兴趣的，可以读一下我们bioRxiv preprint的文章。

学术报告

CGM 第3期：植物的微生物世界

2017-03-29

结束了一天的忙碌，让我们来杯最爱的饮品或是准备些喜爱的茶点，找个舒适的坐姿，一起来探究微生物的世界… 我们都知道人类赖以生存的环境里充斥着微生物，但你知道人类身体内90%的细胞，99%的基因是来自微生物吗？大家对微生物的微世界知多少？它们是敌是友？实际上，人类和微生物的关系源远流长，早在我们还没有发明“微生物”这个名词，显微镜还没有出现，更没有实际观察到它们的微世界时，我们的祖先已经利用它们……

学术报告

CGM 第2期：作物驯化的进化遗传学展望

2017-03-15

在过去的13000年时间里，人类的祖先从野生植物中驯化出了上百种植物，做为我们今天的主要粮食来源。从进化遗传学角度理解作物的驯化对解决粮食问题和深入理解进化论都有重要价值。主讲人将简单介绍这方面的研究进展，并提出几个未来该领域的研究方向，和参与的同学一起探讨。也欢迎大家关注主讲人的个人主页：http://xinshuaiqi.weebly.com/

学术报告

CGM 第1期：以植物进化史为鉴，预测未来优良作物

2017-03-01

中文摘要，于是可以搞得文艺一点。七万年前，关于智人的事情，我们叫做历史；十几亿年前，有机物遗传DNA的事情，我们称之为进化；三十多亿年前，无机物相互作用的事情，我们归结为化学；一百多亿年前，宇宙大爆炸关于物质的事情，成为物理学。不是我总结的，以上来自Harari的《Sapiens: A Brief History of Humankind》。是不是在说，一切事实已然存在，我们只是在试图……

1
2
3
10
11