学术报告

CGM 第140期: 关于染色体结构和功能以及转录调控的多组学研究

2021-03-03

在人类基因组中，通过分析染色体的生物化学修饰，我们已经鉴定和发现了几百万的顺式调控元件(cis-regulatory elements)。这些顺式调控元件为包括启动子（promoter），增强子（enhancer），绝缘子（insulator）以及抑制子（repressor）。绝大部分的顺势调控元件位于基因组的非编码区的“开放”染色质(open chromatin)区域，并对基因转录的时空调控发挥……

学术报告

CGM 第138期: 水稻数量性状变异图谱辅助水稻育种

2021-02-24

报告简介: 对水稻数量性状变异图谱的构建及RiceNavi程度的开发作简单介绍，并对水稻基础研究成果如何服务育种进行探讨。报告亮点: 1. 水稻数量性状变异图谱的构建 2. RiceNavi程序的开发 3. 如何辅助遗传分析及分子设计育种 4. 对未来发展方向的一些思考最近的二十年里，大量的水稻QTL基因被克隆。我们从大量水稻基因文献中，剔除了来自突变体定位或反向遗传学研究的基因，通过逐一阅读……

学术报告

CGM 第139期: 法医基因组学介绍

2021-02-24

法医基因组学是在传统法医遗传学基础上的进一步提升。经典的法医遗传学主要解决三个问题：个体识别，亲缘关系鉴定，以及混合样本解析。过去几十年法医遗传学在全球范围已经取得了巨大的成就，成功鉴定了几千万个亲缘关系，破获了数百万起案件。随着技术的进步和办案需求的进一步深化，基因组学及其相关多组学的相关技术被更多的应用到法庭科学当中，用以描述样本的各类特征以及推断个体死亡原因等等。基因高密度SNP的数据库可用……

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CGM 第137期: 作物驯化的群体遗传学与育种：结构变异与有害变异

2021-02-17

群体遗传学作为遗传学的主要分支与进化生物学的数学原理。随着基因组大数据资源的井喷式累积，群体遗传学正在由理论引领实验向实验引领理论的方向发展。在基础研究方面，群体遗传学将与机器学习算法结合，有助于进一步研究进化的基本原理；在应用方面，群体遗传学的进展将促进农学，医学，人口学与保护生物学等方面实践的快速发展。围绕作物群体遗传学与育种这一核心，综合多组学数据，群体遗传学，数量遗传学与机器学习算法，找……

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CGM 第136期: 玉米驯化和育种改良过程中非基因调控区的比较基因组学研究

2021-02-03

尽管非基因区被认为广泛参与了控制作物农艺性状以及参与驯化和育种改良过程，目前在玉米中对非基因区功能的研究，尤其是远离基因的distal non-genic区域的功能的研究还相对较少。在本研究中，我们利用大规模玉米群体重测序鉴定了玉米驯化、改良和现代育种三个关键过程中受选择的基因组区间，并发现超过70%的受选择区都定位于远离基因的distal non-genic区域。我们进一步利用三维基因组数据鉴定……

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CGM 第135期: 杂交物种形成的分子遗传机制

2021-01-27

同倍体杂交物种形成（homoploid hybrid speciation, HHS）是进化生物学领域的研究热点之一，一直广为人们所关注。杂交物种与亲本物种间生殖隔离（reproductive isolation, RI）的形成及其分子遗传机制是理解该过程的核心。近年来，同倍体杂交物种形成的报道越来越多，而其背后的分子遗传机制与杂交过程中导致生殖隔离的关键成种基因（HHS基因）则鲜有报道。本研究……

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CGM 第133期: 农业呼唤新的绿色革命

2021-01-20

1986年7月获安徽师范大学学士学位。1989年7月获中国科学院植物研究所硕士学位。1996年12月获德国马丁.路德大学(Martin-Luther University)博士学位，1997年进入德国 Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) 进行博士后研究。1999年入选中国科学院“百人计划”，引进国外杰出人才；2004年……

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CGM 第134期: RAF-SnRK2激酶级联途径介导的渗透胁迫和脱落酸信号途径

2021-01-20

干旱、冷和盐会导致渗透胁迫，抑制植物的生长并严重影响农业生产。目前对于植物如何感受和响应渗透胁迫的分子机制了解较少。已知SnRK2蛋白激酶迅速被渗透胁迫所激活。我们通过磷酸化蛋白组学和遗传学方法发现RAF蛋白激酶能磷酸化并激活SnRK2蛋白激酶。raf多突变体对于渗透胁迫敏感。同时我们还发现RAF-SnRK2激酶途径参与了植物激素脱落酸（Abscisic Acid）的信号途径，对于ABA激活……

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CGM 第132期: 马铃薯自交衰退的遗传基础

2021-01-13

马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物。与其它谷物类粮食作物不同，马铃薯是依靠薯块繁殖的同源四倍体物种。隐性有害等位基因隐藏在高度杂合的四倍体基因组中，使得优良等位基因很难聚合在一起，这是导致马铃薯育种周期长的主要原因。一些上百年历史的马铃薯品种仍然在广泛种植，如美国的Russet Burbank（1902年育成）和荷兰的Bintje（1904年育成）。中国栽培面积最大的品种“克新1号”是1958年……

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CGM 第131期: 棉属多倍化与驯化历程中的顺反式表达调控进化

2021-01-06

基因表达的调控变异对于产生新表型和驱动物种形成具有重要作用。近年来，在全基因组水平解析顺式和反式调控差异，已经成为了在物种间、种群内、乃至不同环境下探索表型差异与进化的关键手段。然而由于植物中的多倍化现象普遍存在并增加了重复基因调控的复杂性，人们对农作物驯化的调控进化基础仍知之甚少。以陆地棉的驯化过程为例，为研究棉纤维发育这一复杂表型的调控进化基础，我们采用等位基因特异表达分析方法比较了作为亲本的……

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