- 题目：CGM 第119期：玉米DNA甲基化的驯化及其对功能基因组的影响
- 时间：美国中部时间 2020年10月28日（星期三）8PM（北京时间10月29日 9AM）
- 地点：Zoom and YouTube live stream
- 主讲人：徐根，2011年在扬州大学获得农学学士学位；2018年在中国农业大学作物遗传育种专业毕业，获农学博士学位，博士期间主要从事高油玉米人工选择响应的研究；2018年至今在University of Nebraska-Lincoln Dr. Jinliang Yang实验室进行博士后研究，主要从事玉米群体基因组和表观基因组学的研究。
中文摘要
DNA甲基化作为一种重要的表观修饰，影响DNA的染色质状态以及基因的表达，对植物的生长发育和逆境胁迫均有重要作用。目前对DNA甲基化表观遗传学机制的研究已较为深入，然而DNA甲基化在玉米驯化过程的变化及其对功能基因组的影响鲜有报道。本研究中，作者对玉米的祖先种大刍草、农家种以及现代玉米的DNA进行了全基因组重测序和甲基化测序。分析结果表明 ：（1）DNA甲基化在玉米驯化过程中受到较弱的选择；（2）驯化过程中DNA甲基化水平变化较大的区域可解释较多的遗传变异；（3）共检测到约5000个群体水平的DNA甲基化分化区（DMR），并且发现这些DMR富集在基因组受选择区域；（4）现代玉米中低甲基化的DMR显著富集在基因的远程调控区，且影响基因的表达；（5）HiChIP及LUC实验表明vgt1-DMR 和tb1-DMR可能作为增强子调控下游基因的表达。综上，该研究揭示了玉米DNA甲基化的驯化模式，检测到的甲基化变异位点为现代玉米品种的改良提供了新的思路。
参考文献
G. Xu, J. Lyu, Q. Li, H. Liu, D. Wang, M. Zhang, N. M. Springer, J. Ross-Ibarra, J. Yang, Evolutionary and functional genomics of DNA methylation in maize domestication and improvement, Nature Communications (in press), 2020.