- 题目：CGM 第173期: 超大基因组为转座子的动态模型提供实证检验
- 时间：美国中部时间 2021年7月28日（星期三）7AM（北京时间7月28日9PM）
- 地点：Tecent and Bilibili live stream
- 主讲人：王杰，2010年至今于中国科学院成都生物研究所生物多样性与生态系统服务领域工作。主要研究方向为动物保护遗传学、动物生态学
中文摘要
转座子是真核生物基因组大小的主要决定因素。对基因组内转座子的特征进行研究，不仅能挖掘转座子与宿主的历史动态，还能揭示转座子对宿主结构与功能的影响。超大基因组在动物中非常罕见，但基因组的扩增却显著改变了宿主细胞的尺寸及生理。两栖动物版纳鱼螈（Ichthyophis bannanicus）具有超大的基因组（大小约12.2G）。
我们的研究发现，鱼螈基因组内转座子的组成与其它两栖类甚为不同。但被易位重组介导的转座子的删除速率则与其它两栖类相似，都非常低，并且转座子的大多数超家族依然活跃，表达量占体细胞总表达量的15%。
我们对文献中有关转座子数量、多样性及活力的模型进行归纳总结，并引入生态学中的香农与辛普森多样性指数对鱼螈与其它模式动物内转座子的多样性进行同样的计算分析，以验证这些模型是否符合实证。
据此提出应将一致性分析引入千差万别的转座子比较研究中，以便最终反映转座子与宿主博弈的共性特征。
参考文献
Jie Wang, Michael W Itgen, Huiju Wang, Yuzhou Gong, Jianping Jiang, Jiatang Li, Cheng Sun, Stanley K Sessions, Rachel Lockridge Mueller. Gigantic Genomes Provide Empirical Tests of Transposable Element Dynamics Models. Genomics Proteomics Bioinformatics, 2021. doi: 10.1016/j.gpb.2020.11.005.