- 题目：CGM 第159期: 苎麻基因组演化特征及纤维性状驯化改良
- 时间：美国中部时间 2021年6月2日（星期三）7AM（北京时间6月2日9PM）
- 地点：Tecent and Bilibili live stream
- 主讲人：刘头明，研究员，博士生导师，麻类研究所南方饲料作物资源与利用研究室副主任。2009年毕业于华中农业大学，获得理学博士学位，之后一直在中国农业科学院麻类研究所工作，主要从事苎麻、大蒜生物学及其饲料化利用研究。先后主持国家自然科学基金等科研项目10余项，获各类科技成果奖3项，其中以第一完成人获得湖南省自然科学奖1项，以第一或通讯作者在Molecular Plant等杂志发表论文35篇，论文被引1000余次。2016年入选中国农业科学院青年英才计划。
中文摘要
报告亮点： 1. 基因组和变异组分析解析苎麻基因组演化特征 2. 结合纤维性状基因的挖掘，探究苎麻驯化过程中纤维性状选择印迹。
报告简介: 苎麻是我国特有的纤维作物，在我国已有数千年的种植历史。此外，苎麻嫩茎叶粗蛋白含量高（~20%），且具有生物产量大、可多茬收割等优点，近年来在我国南方地区也被用作优质饲草作物；但苎麻作为饲草，其纤维含量过高会显著影响其饲草加工和动物采食性能。因此，解析苎麻纤维形成机制，对于定向选育高纤维纤用苎麻或低纤维饲用苎麻均具有重要的意义。分类学、遗传学等证据均表明栽培苎麻是从野生苎麻（Boehmeria nivea var. tenacissima）驯化而来，但野生苎麻纤维产量并不高。可见，在栽培苎麻驯化过程中，纤维发育相关基因受到了重点选择。然而，有关栽培苎麻的驯化分子机制，当前仍不清楚。 我们研究团队测序组装了野生种“青叶苎麻”和栽培种“中饲苎1号”基因组，得到两个高质量的基因组。通过序列比较发现两个基因组存在大量序列变异，另外在野生和栽培种鉴定到一些物种特有的基因家族。我们进一步对14个野生苎麻种和46个栽培种进行重测序，并构建了苎麻的基因组变异图谱。结合转录组表达分析，遗传群体QTL定位及选择性清除分析等，发现了多个与纤维产量相关的基因组片段具有清晰的驯化选择印迹。
参考文献
Wang Y, Li F, He Q, Bao,Z, Zeng,Z, An,D, Zhang T, Yan L, Wang H, Zhu S, Liu T* (2021) Genomic analyses provide comprehensive insights into the domestication of bast fiber crop ramie (Boehmeria nivea). The Plant Journal https://doi.org/10.1111/tpj.15346