- 题目：CGM 第154期: 单细胞RNA组原位测序技术
- 时间：欧洲中部时间 2021年5月5日（星期三）8PM（美国中部时间 5月5日 1PM，北京时间 5月6日 2AM）
- 主讲人：千晓雁（Xiaoyan QIAN），2012年于复旦大学获理学学士学位；2014年于瑞典乌普萨拉大学获硕士学位；2019年获博士学位。2017年参与创办新创公司Cartana AB。公司提供原位测序（in situ sequencing）相关试剂盒及服务。博士及Cartana任职期间主攻原位测序影像及数据分析。自Cartana被10x Genomics收购以后，加入10xGenomics，任职高级计算生物学家。
中文摘要
介绍原位测序技术，以及其与目前获得广泛应用的单细胞测序如何互补，将位于组织中的不同细胞进行细胞类型及亚型归类。 近年来，单细胞测序获得广泛的应用，以期利用细胞相关信息更深入了解复杂生演讲摘要物体。但是单细胞技术要求单个细胞的分离，于是丢失了细胞原来所在位置信息。相反，原位测序在组织原位上对RNA分子进行分析，能保有原来的位置信息。此次演讲将着重于我们如何利用单细胞测序数据获得与细胞类型紧密相关的 RNA分子标记，利用原位测序检测上述分子标记于组织中的分布，并利用新型分析方法将位于组织中的细胞归类为已知细胞类型及亚型。演讲中也会提到其他 Cartana曾参与的项目中，如何采用不同的分析方法可以最大化利用单细胞以及原位测序。
应千博士要求，本期演讲结束后视频不会上传 YouTube 或 Bilibili 等线上平台，欢迎大家观看直播参与活动并禁止录像。
参考文献
Qian, X., Harris, K.D., Hauling, T. et al. Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ. Nat Methods 17, 101–106 (2020).