- 题目：CGM 第 146 期: 脑瘤复发的表观机制研究和液体活检技术的开发
- 时间：美国中部时间 2021 年 03 月 31 日（星期三）8PM（北京时间 04 月 01 日 星期四 9AM）
- 地点：Zoom and YouTube live stream
- 主讲人：李佳, 博士，现任 Texas A&M University 转化医学院助理教授。李佳博士 2015 年毕业于中国农业大学获理学博士学位。2016 年开始在 Texas A&M University 表观与疾病预防中心任研究助理科学家。2020 年 09 月开始任研究助理教授，测序中心副主任。利用生物信息学方法研究由 DNMT 和 TET 介导的 DNA 甲基化和羟甲基化在细胞分化，器官发育和癌症发生，发展，耐药性的表观调节作用和临床应用研究。以第一 / 共一作者 / 共同通讯在 Sci Adv，Nat Commun，NAR，JCI，JACS，Brief Bioinformatics 等期刊发表多篇研究论文。主持 CPRIT 基金一项。
中文摘要
与成人肿瘤相比，少儿脑瘤具有基因突变频率超低的特征。少儿 EPN 是一种常见的恶性儿童脑肿瘤，大概 50% 的病人会复发，一旦复发，病情会急剧恶化，而且目前尚没有有效的治疗方法。我们收集了来自 10 个病人的多次复发的肿瘤样本，对 DNA 甲基化和基因表达进行了时序性比较分析，鉴定出了可以预测 EPN 复发的 DNA 甲基化标记及其潜在的调节基因。同时，我们也发现了复发过程中的 DNA 甲基化趋于同化的现象。最终，与对照组相比，我们发现结合放疗和新的 LSD1 抑制剂小分子处理的 PDOX 小鼠具有显著延长的生存期。 癌症的早期检测可以大大提高患者的治疗效果和生存时间，是精准肿瘤医学的重要研究方向。基于下一代测序技术检测 DNA 突变的液体活检技术由于 cfDNA 极低的含量，较低的肿瘤基因突变频率，较高的噪音背景等因素很大程度限制了其广泛临床应用。更重要的是对于非基因突变导致的癌症，基于 DNA 突变的技术则无法进行早期检测。髓母细胞瘤（Medullablastoma，MB）是儿童中最常见的恶性脑肿瘤且具有极低的基因组突变频率（几乎近于无），而 DNA 甲基化在 MB 的发生和发展过程中有着显著的动态变化。影像学和病理学的检测结果相对癌症的发生有明显的滞后。因此，如何早期的检测 MB 的发生，并进行早期干预治疗是急需解决的临床问题。血脑屏障阻止脑瘤 DNA 被释放到血液中，而脑脊液（Cerebrospinal Fluid，CSF）在中枢神经系统中不断循环，与脑瘤细胞频繁接触。脑肿瘤 DNA 可以被直接释放到脑脊液中；而非脑瘤患者的脑脊液中几乎不含有 DNA，这一特征使得脑脊液具有很低的背景噪音。脑脊液可以作为脑瘤理想的液体活检的媒介。我们于世界首次开发利用 CSF cfDNA 全基因组甲基化的液体活检技术（实验和计算）可以应用于其他脑瘤和脑转移瘤的早期检测。
参考文献
Li J, Zhao S, Lee M, Yue Y, Li J, Zhou Y, Ballester L, Esquenazi Y, Dashwood R, Davis P, Parsons D, Li X, Huang Y, Sun D. Reliable tumor detection by whole-genome methylation sequencing of cell-free DNA in cerebrospinal fluid of pediatric medulloblastoma. Science Advances. 2020. 6:eabb5427
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