- 题目：CGM 第146期: 脑瘤复发的表观机制研究和液体活检技术的开发
- 时间：美国中部时间 2021年03月31日（星期三）8PM（北京时间04月01日 星期四 9AM）
- 地点：Zoom and YouTube live stream
- 主讲人：李佳, 博士，现任Texas A&M University 转化医学院助理教授。李佳博士2015年毕业于中国农业大学获理学博士学位。2016年开始在Texas A&M University 表观与疾病预防中心任研究助理科学家。2020年09月开始任研究助理教授，测序中心副主任。利用生物信息学方法研究由DNMT和TET介导的DNA甲基化和羟甲基化在细胞分化，器官发育和癌症发生，发展，耐药性的表观调节作用和临床应用研究。以第一/共一作者/共同通讯在 Sci Adv，Nat Commun，NAR，JCI，JACS，Brief Bioinformatics 等期刊发表多篇研究论文。主持CPRIT基金一项。
中文摘要
与成人肿瘤相比，少儿脑瘤具有基因突变频率超低的特征。少儿EPN是一种常见的恶性儿童脑肿瘤，大概50%的病人会复发，一旦复发，病情会急剧恶化，而且目前尚没有有效的治疗方法。我们收集了来自10个病人的多次复发的肿瘤样本，对DNA甲基化和基因表达进行了时序性比较分析，鉴定出了可以预测EPN复发的DNA甲基化标记及其潜在的调节基因。同时，我们也发现了复发过程中的DNA甲基化趋于同化的现象。最终，与对照组相比，我们发现结合放疗和新的LSD1抑制剂小分子处理的PDOX小鼠具有显著延长的生存期。 癌症的早期检测可以大大提高患者的治疗效果和生存时间，是精准肿瘤医学的重要研究方向。基于下一代测序技术检测DNA突变的液体活检技术由于cfDNA极低的含量，较低的肿瘤基因突变频率，较高的噪音背景等因素很大程度限制了其广泛临床应用。更重要的是对于非基因突变导致的癌症，基于DNA突变的技术则无法进行早期检测。髓母细胞瘤（Medullablastoma，MB）是儿童中最常见的恶性脑肿瘤且具有极低的基因组突变频率（几乎近于无），而DNA甲基化在MB的发生和发展过程中有着显著的动态变化。影像学和病理学的检测结果相对癌症的发生有明显的滞后。因此，如何早期的检测MB的发生，并进行早期干预治疗是急需解决的临床问题。血脑屏障阻止脑瘤DNA被释放到血液中，而脑脊液（Cerebrospinal Fluid，CSF）在中枢神经系统中不断循环，与脑瘤细胞频繁接触。脑肿瘤DNA可以被直接释放到脑脊液中；而非脑瘤患者的脑脊液中几乎不含有DNA，这一特征使得脑脊液具有很低的背景噪音。脑脊液可以作为脑瘤理想的液体活检的媒介。我们于世界首次开发利用CSF cfDNA全基因组甲基化的液体活检技术（实验和计算）可以应用于其他脑瘤和脑转移瘤的早期检测。
参考文献
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