- 题目：CGM 第 120 期: Data integration and visualization of phylogenetic trees
- 时间：美国中部时间 2020 年 10 月 31 日（星期三）8AM（北京时间 10 月 31 日 9PM）
- 地点：Tecent and Bilibili live stream
- 主讲人：余光创，2017 年毕业于香港大学李嘉诚医学院。2018 由南方医科大学第三层次人才引进（教授，博导），2019 年起任南方医科大学基础医学院生物信息学系副主任（主持工作），以第一作者或通讯作者发表 SCI 论文 20 余篇，主要工作发表在 Molecular Biology and Evolution, Methods in Ecology and Evolution 和 Bioinformatics 上，其中 6 篇为 ESI 高被引论文，被引用 7 千余次（google scholar 数据）。
中文摘要
树结构不易操作，且有大量的相关数据需要整合，以便于在系统发育的背景下对数据进行解析，针对这一问题，我们开发了一系列的 R 包，解决于系统发育树相关文件的读写、数据整合、操作以及可视化等各个方面。
参考文献
G Yu. Using ggtree to visualize data on tree-like structures. Current Protocols in Bioinformatics, 2020, 69:e96. LG Wang, TTY Lam, S Xu, Z Dai, L Zhou, T Feng, P Guo, CW Dunn, BR Jones, T Bradley, H Zhu, Y Guan, Y Jiang, G Yu*. treeio: an R package for phylogenetic tree input and output with richly annotated and associated data. Molecular Biology and Evolution. 2020, 37(2):599-603. G Yu*, TTY Lam, H Zhu, Y Guan*. Two methods for mapping and visualizing associated data on phylogeny using ggtree. Molecular Biology and Evolution. 2018, 35(2):3041-3043. G Yu, DK Smith, H Zhu, Y Guan, TTY Lam*. ggtree: an R package for visualization and annotation of phylogenetic trees with their covariates and other associated data. Methods in Ecology and Evolution. 2017, 8(1):28-36.