• 题目:CGM 第 116 期: 生信小工具 - TBtools 推介
  • 时间:美国中部时间 2020 年 10 月 07 日(星期三)8AM(北京时间 10 月 07 日 9PM)
  • 地点:Tecent and Bilibili live stream
  • 主讲人:陈程杰,09 年入学华南农大,在完成本科及硕士学业后, 现攻读博士学位。主要方向为园艺果树育种(本硕阶段)与生理(博士阶段),业余方向为植物生物信息数据分析。参与发表论文累计 IF 110+,H-index 12,其中以第一作者(含共一)身份发表论文 7 篇。独立运营微信公众号 “生信札记”,开发了一些便利的生信小工具,如 TBtools 和 EasyCodeML。

中文摘要

TBtools ,旨在填补生物学研究和生物信息学软件开发之间被无意忽视的需求缺口:1. 实验人员自主完成分析小任务的可能;2. 功能调用的直观友好和操作的便利;3. 开箱即用和多功能的集成四、发表级图形的准备与可交互操作等。目前,该软件开放功能超过 140 个,包含序列操作,文本处理,生信数据可视化,甚至益智小游戏。自主开发的 Java 绘图引擎,使得 TBtools 可以高效且快速的增加或者优化数据可视化功能。 截至今日,TBools 已被引 800 余次,覆盖用户过 2 万。从软件的开发目的出发,新的功能会不断地增加,使得 TBtools 成为一个 “活着的” 软件,从而不断减轻常规生信数据分析的负担。

参考文献

Chen, C., Chen, H., Zhang, Y., Thomas, H. R., Frank, M. H., He, Y., & Xia, R. (2020). TBtools-an integrative toolkit developed for interactive analyses of big biological data. bioRxiv, 289660.

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