- 题目：CGM 第102期：通过表观基因组学发掘植物顺式调控序列”
- 时间：美国中部时间 2020 年 7月 8日（星期三）8PM（北京时间 7月 9日 9AM）
- 地点：Zoom and Bilibili live stream
- 主讲人：中国农业科学院作物科学研究所研究员，博士生导师，中国农业科学院“青年英才计划”引进人才。2008年获得山东大学学士学位，2015年获得中国科学院遗传与发育生物学研究所博士学位。2015年-2019年在佐治亚大学进行博士后研究。2020年3月加入作物科学研究所，主要从事植物表观基因组学与基因表达调控等方面的研究。近年来以第一作者在Nature Plants、Cell Research、Molecular Plant、Plant Cell、Nucleic Acids Research等期刊发表论文7篇，受邀在Current Opinion in Plant Biology发表综述1篇 。
中文摘要
非编码区是植物基因组中的重要组成部分，在小麦、玉米等作物中甚至超过95%。非编码区中存在与基因表达密切相关的顺式调控序列(Cis-Regulatory Elements，CREs)，包括启动子、增强子、抑制子等。转录因子等DNA结合蛋白与CREs的互作决定了基因的时空特异表达。CREs中的多态性位点可以解释众多的表型变异与数量性状，与抗病、分枝、开花时间、抗逆等重要表型密切相关。CREs通常表现出特异的表观修饰特性，其开放程度较高、邻近核小体往往存在特定的组蛋白修饰。基于这些特点我们在大豆、玉米、水稻等13种植物中鉴定了调控序列，并证明了植物中也广泛存在远距离的调控元件。远距离CREs可以通过染色体高级结构与目标基因互作，参与目标基因的表达调控。此外，CREs在进化上更为保守，其与目标基因的距离与转座子的插入跳跃密切相关。这些结果对阐明植物基因表达调控机制，解释高等植物非编码区调控序列的起源进化都有重要意义。
参考文献
- Lu, Z., Marand, A.P., Ricci, W.A., Ethridge, C.L., Zhang, X., Schmitz, R.J. (2019) The prevalence, evolution, and chromatin signatures of plant regulatory elements. Nat Plants 5:1250-1259
- Ricci W.A.*, Lu Z.*, Ji L.*, Marand A.P., Ethridge C.L., Murphy N.G., Noshay J.M., Galli M., Mejia-Guerra M.K., Colome-Tatche M., Johannes F., Rowley M.J., Corces V.G., Zhai J., Scanlon M.J., Buckler E.S, Gallavotti A., Springer N.M., Schmitz R.J., Zhang X. (2019) WidespreadLong-range Cis-Regulatory Elements in the Maize Genome. Nat Plants 5:1237-1249