- 题目：芡实和金鱼藻揭示被子植物早期演化关系
- 时间：北京时间2020年4月22日9PM（美国西部PST时间 4 月 22 日（星期三）6AM）
- 地点：Zoom and Bilibili live stream
- 主讲人：杨勇志，兰州大学青年研究员，硕士生导师。2012年、2018年分别在兰州大学获得学士学位和博士学位，师从刘建全教授。主要使用比较基因组学、群体遗传学等手段，围绕物种适应性进化的遗传机制和濒危物种的群体维持机制开展研究。近年来以第一作者、并列一作和通讯作者在Nature Plants、Nature Communications、Molecular Ecology Resources等杂志发表多篇研究论文。
中文摘要
被子植物（Angiosperm）又称开花植物或有花植物，全世界范围内超过35万种，是人类大部分食物的来源，并为地球光合作用和碳固定做出了重要贡献。被子植物兴起于三叠纪晚期到晚白垩纪，由于强大的适应能力逐渐取代裸子植物在陆表植物中占据主导地位，同时也演化出了多个水生植物的类群，极大地影响了昆虫、两栖动物、哺乳动物、蕨类植物，以及许多其它生物类群的多样化进程，重塑了全球各大陆块主要生态系统格局。由于化石证据链和分子证据的不完整，以及早期分化被子植物的代表性物种基因组的缺乏，其早期分化和系统发育关系仍然不清楚。本研究对两种早期演化分支的水生植物代表种：芡实和金鱼藻，进行了基因组测序，装配出染色体水平的基因组序列，通过与其它代表性陆生被子植物代表基因组进行了深入的比较分析，揭示了被子植物早期的复杂演化历史：被子植物的五个主要演化分支，金鱼藻、睡莲类（芡实为代表）、木兰类、单子叶植物和真双子叶植物，早期都经历了独立的多倍化事件，芡实和金鱼藻最近都还经历了一次基因组加倍；利用多个数据集和多种方法的解析了被子植物系统发育关系，同时证明，除杂交外，不完全谱系筛选可能是早期被子植物辐射分化过程中，引起主要分支之间基因树、或核基因组-叶绿体基因组系统发育树分支关系不一致的主要原因。这些研究对于阐明被子植物中主要分支的演化次序和生境转变，同时为后续生命之树，特别是水生被子植物适应性演化、不同类群加倍事件的研究都提供了基本框架。
参考文献
Yang Y#, Sun P#, Lv L, Wang D, Ru D, Li Y, Ma T, Zhang L, Shen X, Meng F, Jiao B, Shan L, Liu M, Wang Q, Qin Z, Xi Z*, Wang X*, Davis C*, Liu J*. 2020. Prickly waterlily and rigid hornwort genomes shed light on early angiosperm evolution. Nature Plants 6, 215–222.