- 题目：种群基因组学揭示的银杏进化历史
- 时间：2019 年 10 月 23 号（星期三），北京时间 9:00 PM
- 地点：全时云和哔哩哔哩直播
- 主讲人： 赵云鹏，浙江大学生命科学学院/生态研究所副教授、博士生导师，浙江大学青年求是学者。2000年、2003年获南京农业大学学士和硕士学位，2006年获浙江大学博士学位。2006–2008年浙江大学师资博士后，2011–2013年德国海德堡大学访问学者（浙江大学新星计划）。研究方向为濒危树种进化生态学与保护基因组学，研究的植物类群主要是中国特有的活化石树种银杏、珙桐等。近年来在Nature Communications、eLife、GigaScience、Molecular Phylogenetics and Evolution、BMC Genomics等期刊发表多篇论文，现任Plant Systematics and Evolution编委。
中文摘要
活化石类群起源古老，往往一个支系仅现存一个物种，形态性状保守，现存分布范围狭窄，具有重要的保护价值，达尔文认为活化石是研究物种灭绝、竞争、适应性等进化生物学核心问>题的绝佳体系。银杏(Ginkgo biloba L.)是著名的活化石森林树种，其祖先起源于2.45亿年前，尽管经历了地质历史时期的多次全球气候震荡以及人类历史时期的人类活动干扰，但银杏>仍然存活至今，并在全球广泛栽培，因此，银杏被认为是人类保护和复兴濒危物种的正面案例。但现存银杏是否应该得到重点保护一直存在很大争议，具体体现为两个核心科学问题：一>是银杏是否仍存在野生种群？野生种群分布在中国哪些地方？二是银杏是如何幸存下来？其进化潜力如何？ 本研究在染色体水平HiC基因组组装和分析的基础上，利用国产BGISEQ-500二>代测序仪，对采自全球51个种群545棵银杏大树进行了全基因组测序，产出了44Tb的海量数据，构建了迄今最大的非模式物种序列变异数据库。利用这些数据，我们全面鉴定了银杏种群的
遗传格局和避难所，揭示了现存银杏全球分布格局的基本成因，检验了活化石灭绝漩涡假说，为银杏的后续研究建立了进化框架，为其种质资源开发提供了宝贵的遗传资源，而且为其他>活化石物种的研究和保护提供了可借鉴的范例，有助于最终揭示物种适应和灭绝的规律和机制。