学术报告

CGM 第79期：Benchmarking transposable element annotation methods for creation of a streamlined, comprehensive pipeline

2020-01-22

[…] 转座子又称自私基因、基因组暗物质，是真核生物基因组中高度重复的一类遗传物质。按照转座子的复制形式，它一般分为两大类：由DNA作为载体的DNA转座子和由RNA作为中间载体的RNA转座子（或称逆转录内源病毒）。根据转座子的重复特性、序列内容和结构特征，科学家开发了各种各样、五花八门的软件和程序去检测、注释转座子，但却没有人系统比较过这些软件准不准确、好不好用。更加缺乏的是一个高质……