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2024-01-01
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学术报告
CGM 第38期:在进化生物学的框架下利用深度学习预测基因表达
2018-09-19
深度学习已经给无数的领域带来了深刻的变革,在分子生物学和基因组学中也同样具有广阔的应用前景。但是,由于基因之间以及物种之间存在进化关系,使得生物学中深度学习模型的建立和训练具有一定的特殊性。如果把其他学科的深度学习模型照搬到生物学领域,可能会造成不准确甚至错误的结论。因此,我们提出两种训练深度学习模型的方式:(1)根据基因家族将数据分为训练集和测试集。(2)利用直系同源基因训练模型。我们用这两种方……