学术报告

CGM 第131期: 棉属多倍化与驯化历程中的顺反式表达调控进化

2021-01-06

基因表达的调控变异对于产生新表型和驱动物种形成具有重要作用。近年来，在全基因组水平解析顺式和反式调控差异，已经成为了在物种间、种群内、乃至不同环境下探索表型差异与进化的关键手段。然而由于植物中的多倍化现象普遍存在并增加了重复基因调控的复杂性，人们对农作物驯化的调控进化基础仍知之甚少。以陆地棉的驯化过程为例，为研究棉纤维发育这一复杂表型的调控进化基础，我们采用等位基因特异表达分析方法比较了作为亲本的……

学术报告

CGM 第32期：Preferential retention of homeologs from a single parental subgenome after polyploidy is shaped by functional interactions and dosage-based intrinsic selective constraint

2018-06-27

全基因组多倍化被认为在植物的演化以及被驯化的过程中起到重要的驱动作用。当亚基因组来自不同物种时，即在异源多倍体（allopolyploidy）中，多拷贝基因会发生不平等的丢失（biased fractionation）：来自某一亚基因组的基因更有可能存留（least fractionated subgenome），而其他的拷贝更易在进化过程中丢失。本次报告将介绍一个基于Markov模型和似然估……

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CGM 第23期：Polyploidy and duplicated gene regulation, stories of cotton 棉花进化那些事儿

2018-02-21

Polyploidy and duplicated gene regulation, stories of cotton 棉花进化那些事儿多倍化这一现象在整个真核生物中普遍存在，尤其是在植物的物种形成及其随后的进化过程发挥了关键的作用。在细胞内，遗传物质的加倍在不同程度上影响着基因表达调控的各个环节，进而推动了生物功能以及表观形态的选择进化历程。我的研究工作是通过功能基因组学，以棉属植……