学术报告

CGM 第31期：Phylogenetic identification of endosymbionts and microbiome

CGM 第31期：Phylogenetic identification of endosymbionts and microbiome

2018-06-13

尽管“操作分类单元”OTU(Operational Taxonomic Units)的弊端众所周知，它却仍然作为微生物分子鉴定，多样性和生态研究的基础单元，被大家普遍应用。OTU的厘定基于遗传距离，一般以3%为界限。当下的多款微生物组（群）microbiome软件，譬如QIIME和MOTHUR，均以计算和分析OTU为主要任务。本次讲座中，张冠阳将介绍如何应用系统发育学的思路和方法对二代测序数……