学术报告

用 Pore-C 技术检测拟南芥基因组多位点互作及关联甲基化修饰信息

2022-03-16

随着高通量测序技术的发展，大量基于二代测序的组学研究技术被陆续开发，人们得以从多个层面了解基因组的组成、结构与功能。染色质捕获技术（Chromosome conformation capture）通过对染色质进行酶切和邻近连接得到的嵌合体序列进行测序，获得染色质互作信息，从而解析基因组的三维结构。其中，Hi-C 和 ChIA-PET 是应用最广的基因组水平染色质捕获技术。Hi-C 和 ChIA-PET 技术在……

学术报告

CGM 第 122 期：番茄中结构变异对基因表达和作物驯化及改良的重要影响

2020-11-11

结构变异（Structural variations）指基因组中比较大范围的变异。之前很多研究表明结构变异是作物驯化和改良相关性状的重要基础。但是，传统的短序列测序方法是鉴定结构变异的瓶颈之一。所以鉴定 SV 在作物中的多样性和其对基因表达和植物性状的定量影响一直具有很大的挑战性。为了全面地研究 SV 在番茄群体中的分布和功能，我们使用纳米孔长序列测序技术鉴定得到了 100 个番茄品系中的 238,490……