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OTU
2024-01-01
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学术报告
CGM 第31期:Phylogenetic identification of endosymbionts and microbiome
2018-06-13
尽管“操作分类单元”OTU(Operational Taxonomic Units)的弊端众所周知,它却仍然作为微生物分子鉴定,多样性和生态研究的基础单元,被大家普遍应用。OTU的厘定基于遗传距离,一般以3%为界限。当下的多款微生物组(群)microbiome软件,譬如QIIME和MOTHUR,均以计算和分析OTU为主要任务。 本次讲座中,张冠阳将介绍如何应用系统发育学的思路和方法对二代测序数……