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LTR
2024-01-01
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学术报告
CGM 第15期:植物中的非典型LTR转座子
2017-09-27
作为真核生物基因组的主要成分,转座子(transposon)可谓是无处不在。由于转座子的结构和序列多样性,准确鉴定转座子仍然是一项挑战性的工作。植物基因组中占比最高的要数长末端逆转录转座子(Long terminal repeats retrotransposon, LTR-RT),其基因组含量可高达75%(玉米)。这次我将会简单讲一下我开发的软件LTR_retriever,用于快速准确地鉴别完整……