学术报告

CGM 第121期:杂合二倍体马铃薯基因组组装与分析

2020-11-04

马铃薯是世界上最重要的块茎类作物。栽培马铃薯主要靠薯块进行无性繁殖，其基因组高度杂合，破译基因组难度较大。本研究的测序的二倍体马铃薯RH，基因组杂合度达到2%。本研究中采用多种测序技术结合的方法进行了二倍体基因组草图的组装，尤其是利用了最新的HiFi read技术获得了高准确率、高连续性的组装片段，并开发了利用测序read数量分布进行基因型鉴定和遗传连锁群构建的方法，成功将同源片段区分成两套单体……