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基因组组装,BioNano光学图谱,scaffolding,错误纠正
2024-01-01
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学术报告
CGM 第123期:基于光学图谱的scaffolding算法研究
2020-11-18
基因组scaffolding是de novo基因组组装的重要步骤。针对BioNano光学图谱数据,我们开发了三种用于基因组scaffolding以及其预处理步骤chimeric contig纠正、组装结果reconciliation的算法工具OMGS、Chimericognizer和Novo&Stitch 。其中,Novo&Stitch是第一种基于光学图谱的组装结……