• 题目:基因组学和表观基因组研究植物重复基因进化
  • 时间:2019 年 07 月 10 号(星期三),美西时间(Pacific Time)6:00 PM
  • 地点:YouTube live stream
  • 主讲人:赵美霞 (Meixia Zhao) Assistant Professor at Miami University Ph.D., 生物化学与分子生物学, 中国农业科学院 及 Purdue University 联合培养博士, 2012

中文摘要

Keywords: Polyploidy, Fractionation, MIRNA Genes, Co-evolution, Recombination

多倍化或全基因组复制是植物基因组的一个重要特征,但目前对于这些重复基因的进化机制并不是很清楚。我的研究利用玉米和大豆两个重要的农作物基因组发现虽然玉米和大豆最近期的一次全基因组复制发生的时间相差不大,但玉米的两个亚基因组在基因表达量,转座子含量,小RNA和DNA甲基化,以及基因丢失数目上差异很大,然而大豆的两个亚基因组之间没有观察到显著差别。尽管如此,大豆的个体重复基因却在这些特征上呈现出显著差异。为进一步研究重复基因的功能分化,我们还对大豆油脂合成中的重复基因的功能进行了研究,阐述了油脂合成重复基因的亚功能化,新功能化以及假功能化。在重复蛋白编码基因的研究之上,我们还探讨了重复MIRNA基因的进化机制,并且发现MIRNA基因和它的靶基因呈现出共同进化的现象。目前我的实验室一个重要的研究项目是探讨表观遗传学比如DNA甲基化和组蛋白修饰以及活性和沉默的转座子是如何影响玉米和大豆减数分裂重组率。

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参考文献

  1. Zhao M., Zhang B., Lisch D., and Ma J. 2017. Patterns and consequences of subgenome differentiation provide insights into the nature of paleopolyploidy in plants. Plant Cell 29: 2974-2994.
  2. Zhang D., Zhao M., Li S., Sun L., Wang W., Cai C., Dierking E., and Ma J. 2017. Plasticity and innovation of regulatory mechanisms underlying seed oil content mediated by duplicated genes in the palaeopolyploid soybean. Plant J. 90: 1120-1133. (Equal contributors)
  3. Zhao M., Meyers B.C., Cai C., Xu W., and Ma J. 2015. Evolutionary patterns and co-evolutionary consequences of MIRNA genes and microRNA targets triggered by multiple mechanisms of genomic duplications in soybean. Plant Cell 27: 546-562.