• 题目:CGM 第119期:玉米DNA甲基化的驯化及其对功能基因组的影响
  • 时间:美国中部时间 2020年10月28日(星期三)8PM(北京时间10月29日 9AM)
  • 地点:Zoom and YouTube live stream
  • 主讲人:徐根,2011年在扬州大学获得农学学士学位;2018年在中国农业大学作物遗传育种专业毕业,获农学博士学位,博士期间主要从事高油玉米人工选择响应的研究;2018年至今在University of Nebraska-Lincoln Dr. Jinliang Yang实验室进行博士后研究,主要从事玉米群体基因组和表观基因组学的研究。

内容简介

DNA甲基化作为一种重要的表观修饰,影响DNA的染色质状态以及基因的表达,对植物的生长发育和逆境胁迫均有重要作用。目前对DNA甲基化表观遗传学机制的研究已较为深入,然而DNA甲基化在玉米驯化过程的变化及其对功能基因组的影响鲜有报道。本研究中,作者对玉米的祖先种大刍草、农家种以及现代玉米的DNA进行了全基因组重测序和甲基化测序。分析结果表明 :(1)DNA甲基化在玉米驯化过程中受到较弱的选择;(2)驯化过程中DNA甲基化水平变化较大的区域可解释较多的遗传变异;(3)共检测到约5000个群体水平的DNA甲基化分化区(DMR),并且发现这些DMR富集在基因组受选择区域;(4)现代玉米中低甲基化的DMR显著富集在基因的远程调控区,且影响基因的表达;(5)HiChIP及LUC实验表明vgt1-DMR 和tb1-DMR可能作为增强子调控下游基因的表达。综上,该研究揭示了玉米DNA甲基化的驯化模式,检测到的甲基化变异位点为现代玉米品种的改良提供了新的思路。

参考文献

G. Xu, J. Lyu, Q. Li, H. Liu, D. Wang, M. Zhang, N. M. Springer, J. Ross-Ibarra, J. Yang, Evolutionary and functional genomics of DNA methylation in maize domestication and improvement, Nature Communications (in press), 2020.

主题:CGM 第119期:玉米DNA甲基化的驯化及其对功能基因组的影响

时间:美国中部时间 2020年10月28日(星期三)8PM(北京时间10月29日 9AM)

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会议 ID:982 6398 9725

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