学术报告

08-16-2023 不完全谱系分流在灵长类演化过程中的影响以及其和选择作用的关系

关键词：Primate; ILS

  • 题目：不完全谱系分流在灵长类演化过程中的影响以及其和选择作用的关系
  • 地点：腾讯会议ID：851-8228-1704
  • 时间：北京时间 8 月 16 日 星期三 8:00 PM
  • 腾讯会议链接：点击进入
  • 主讲人：李芳
    • 学历与经历：
    • 2021年毕业于丹麦哥本哈根大学
    • 导师：张国捷教授
    • 研究领域：系统发育基因组学及不完全谱系分选对动物演化的影响

内容摘要

不完全谱系分流（Incomplete lineage sorting，ILS）是指物种在分化的过程中对祖先群体的多态性进行随机继承的现象。因此，ILS会导致亲缘关系更远的物种因为继承了同一种多态性反而在序列上更相似，对物种演化关系的推测造成影响。此外，ILS也与其他演化信息紧密相关，如祖先群体大小，以及物种分化的时间。另外，演化历程中的多次选择作用也会影响ILS的发生，导致基因组上不同区域ILS的发生频率不同。利用全基因组数据，和基于多物种溯组原理的CoalHMM软件，对29个灵长类祖先节点的ILS现象进行了分析。发现在灵长类祖先节点发生了不同程度的ILS，且ILS的发生与重组和选择相关。基因组上存在某些区域，在整个灵长类的演化过程中一直保持着较高或者较低的不完全谱系分流水平，这也反应了这些区域曾面临不同的选择压力。

参考文献

  • Rivas-González, I., et al., Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection in primates. Science, 2023. 380(6648): p. eabn4409.

关键词

  • Primate,ILS
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