- 题目:整合式空间多组学技术揭示肿瘤代谢微环境特征
- 地点:腾讯会议ID:851-8228-1704
- 时间:北京时间 8 月 9 日 星期三 8:00 PM
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主讲人:孙成龙研究员
- 学历与经历:
- 博士:北京协和医学院
- 硕士:中国药科大学
本科:华中科技大学
工作经历:齐鲁工业大学(山东省科学院)药物代谢与分子成像团队课题组长
研究领域:质谱(成像)新方法开发、药物及肿瘤代谢研究
内容摘要
组学技术的发展极大地推动了人们对肿瘤的认识和临床精准诊治。然而,基于组织匀浆或单细胞解离的组学分析技术会破坏组织中细胞和分子所处的空间位置,无法获得高异质性肿瘤组织(微环境)中的分子和细胞的分布及相互作用信息。在前期自主研发的空间代谢组学(Spatially resolved metabolomics)技术的基础上,进一步整合空间脂质组学(Spatially resolved lipidomics)和空间转录组(Spatially resolved transcriptomics)测序技术,在同一肿瘤组织样本的相邻切片上,实现了肿瘤组织微区中代谢组、脂质组和转录组数据的原位精准联合分析;并鉴别细胞种类,构建代谢物/脂质和上游调控基因的关联网络,实现了肿瘤组织微环境中肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞等代谢调控及交互作用的原位表征;为肿瘤代谢的深入研究提供了创新的有效方法、工具和新视角。
参考文献
- Sun C, Wang A, Zhou Y, Chen P, Wang X, Huang J, Gao J, Wang X, Shu L, Lu J, Dai W, Bu Z, Ji J, He J. Spatially resolved multi-omics highlights cell-specific metabolic remodeling and interactions in gastric cancer. Nat Commun. 2023 May 10;14(1):2692. doi: 10.1038/s41467-023-38360-5. PMID: 37164975; PMCID: PMC10172194.
关键词
- 空间多组学,胃癌,肿瘤代谢, 微环境