- 题目：综合多组学数据和分析揭示康乃馨关键观赏性状的调控通路
- 时间：美国中部时间 2022年03月23日（星期三）7AM（北京时间03月23日9PM）
- 地点：Tecent and Bilibili live stream
- 主讲人:张晓妮，本科毕业于山东农业大学，博士毕业于华中农业大学（导师：王彩云/傅小鹏教授），博士期间从事石竹属植物再生体系、遗传转化体系的开发与利用，以及康乃馨等观赏植物的重要观赏性状的解析。2019年在中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所开展博士后研究，合作导师为武志强研究员。 研究方向：利用多组学解析康乃馨等观赏植物重要性状的分子机理。
中文摘要
本研究对康乃馨栽培品种‘斯嘉丽’（ D. caryophyllus, cultivar‘Scarlet Queen’）进行了全基因组测序和组装。康乃馨（2n=30）的基因全长为636.30 Mb，重复序列占70.62%，共注释到43,925个基因，Contig N50 为14.67 Mb。研究发现康乃馨与藜科在~64.07 MYA发生了分化，并经历了一次近期的WGT事件，这次加倍事件促进了康乃馨特殊香气丁香酚合成相关的基因的扩张。 基于本基因组，对康乃馨红边花瓣进行代谢组分析，发现天竺葵素的积累促使花瓣红边的成色，叶黄素和多个类黄酮物质的共同积累，促使花瓣基部成黄色，结合转录组分析，筛选到MYBs, bHLHs 和WRKY44等基因共同作用于ANS调控康乃馨花边的形成。研究还发现丁香酚合成酶基因存在于外显子上的结构变异，可能是康乃馨丁香酚丢失的原因。另外，发现康乃馨A、C类基因的异位表达可能是影响重瓣型康乃馨形成的重要因素。 本研究的开展为康乃馨重要观赏性状的调控和遗传改良提供了宝贵的数据信息和坚实的理论基础，对推动康乃馨分子育种具重要的意义。
参考文献
Xiaoni Zhang, Shengnan Lin, Dan Peng, Quanshu Wu, Xuezhu Liao, Kunli Xiang, Zehao Wang, LukeR. Tembrock, Mohammed Bendahmane, Manzhu. Bao, Zhiqiang WU, Xiaopeng FU. Integrated multi-omic data and analyses reveal the pathways underlying key ornamental traits in carnation flowers, Plant Biotechnology Journal, 2022 (doi/10.1111/pbi.13801)