• 题目:植物独特的转录机制:两种 RNA 聚合酶高效协作合成双链 RNA 的转录机制
  • 时间:美国中部时间 2022 年 02 月 16 日(星期三)7AM(北京时间 02 月 16 日 9PM)
  • 地点:Tecent and Bilibili live stream
  • 主讲人: 黄坤,本科毕业于安徽农业大学园艺学院;现为中科院分子植物科学卓越创新中心张余课题组 2018 级硕博连读生。 基因组中的遗传信息得以表达,需要 RNA 聚合酶进行转录。以 DNA 为模板合成 RNA 的转录过程不仅是基因表达第一步,还是基因表达的主要调控步骤。因此对 RNA 聚合酶分子机器结构、运行机理以及调控机制的研究能够回答基因表达精密调控的基础生物学问题。目前所在课题组主要结合生物化学、结构生物学及微生物学等手段围绕单亚基和多亚基 RNA 聚合酶分子机器为中心,探索转录的调控机制。 徐洲更, 本科毕业于浙江农林大学;现为中科院分子植物科学卓越创新中心王佳伟课题组 2016 级硕博连读生。 目前主要从事的是植物的高通量测序数据的分析,例如 2019 年作为共同第一作者(第二位)参与拟南芥茎尖单细胞图谱解析工作,2021 年作为共同第一作者(第四位)参与了植物 RNA 聚合酶 Pol IV 结构解析工作。 除学术工作外,也持续在微信公众号,哔哩哔哩,个人博客站点等平台上发表自己的生物信息学学习心得,包括文字和视频教程。

中文摘要

DNA 甲基化通过影响基因的表达来维持基因组的稳定性。在植物中,DNA 依赖的 RNA 聚合酶 IV(Pol IV)与 RNA 依赖的 RNA 聚合酶 2(RDR2)协作合成 DNA 甲基化建立和维持所必需的双链小干扰 RNA。我们解析了植物 RNA 聚合酶 Pol IV-RDR2 全酶和 Pol IV-RDR2 转录回溯延伸复合物结构冷冻电镜结构。研究结果展示了真核生物第四个 RNA 聚合酶的三维结构和首例两种 RNA 聚合酶(Pol IV 和 RDR2)形成的复合物的独特构造,并且揭示了 Pol IV-RDR2 复合物以 dsDNA 为模板输出 dsRNA 的特殊转录模式和机制。

本讲座徐洲更同学还将进行生物信息学的自学心得体会分享: 徐洲更同学凭借着自己对生信的兴趣,以及导师的鼓励和信任,开始自学生信,并在网络上分享自己的学习心得。在课题组的生信分析项目磨练中,不断成长,并开始指导课题组的其他成员的生信学习。 本次演讲,主要分享自己在生信自学路上的心得体会,供大家参考。

参考文献

Huang K, Wu XX, Fang CL, Xu ZG, Zhang HW, Gao J, Zhou CM, You LL, Gu ZX, Mu WH, Feng Y, Wang JW, Zhang Y. Pol IV and RDR2: A two-RNA-polymerase machine that produces double-stranded RNA. Science. 2021 Dec 24;374(6575):1579-1586. doi: 10.1126/science.abj9184. Epub 2021 Dec 23. PMID: 34941388.

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