- 题目：CGM 第194期:绞股蓝染色体水平基因组组装及绞股蓝皂苷生物合成调控网络简析
- 时间：美国中部时间 2021年11月3日（星期三）7AM（北京时间11月3日9PM）
- 地点：Tecent and Bilibili live stream
- 主讲人:黄鼎，男，博士，副研究员，硕士生导师。2018年毕业于华中农业大学园艺林学学院，果树学专业，师从徐强教授。2019年至今在广西中医药大学药学院工作，研究方向为药用植物次生代谢生物合成与调控。目前主持省部级项目2项，过去五年以第一作者或通讯作者在Nature Plants（封面论文）、Plant Cell &Environment（封面论文）等杂志发表多篇高水平论文。
中文摘要
绞股蓝是葫芦科植物中具有较高经济价值的药用植物，其主要药效成分为绞股蓝皂苷，与人参、三七中的主要活性成分结构相似，均为达玛烷型四环三萜皂苷，因此也有“南方人参”的美誉。绞股蓝基因组图谱的缺乏制约了其功能基因组学和分子育种的发展。
近期本课题组组装了高质量的绞股蓝基因组，组装得到的绞股蓝基因组大小为582Mb，contig N50为1.71Mb, scaffold N50为50.78Mb。该基因组包含59.14%的重复序列，并从中预测到了25,285个蛋白质编码基因。通过来自七个组织的转录组数据，利用组织特异性基因共表达分析重建了绞股蓝苷生物合成途径和潜在的调控网络。鉴定到4个UDP-葡萄糖醛酸转移酶(UGTs)形成一个基因簇，可能参与催化绞股蓝苷生物合成中的糖基化反应，同时也鉴定到了一系列的候选转录因子，为进一步研究绞股蓝皂苷生物合成调控机制奠定了基础。
参考文献
Ding Huang, Ruhong Ming, Shiqiang Xu, Jihua Wang, Shaochang Yao, Liangbo Li, Rongshao Huang, Yong Tan, Chromosome-level genome assembly of Gynostemma pentaphyllum provides insights into gypenoside biosynthesis, DNA Research, 2021, dsab018, https://doi.org/10.1093/dnares/dsab018