• 题目:基于图泛基因组的谷子种质资源挖掘与应用
  • 地点:- 腾讯会议 ID: 851-8228-1704
  • 腾讯会议时间:北京时间 7 月 12 日 星期三 08:00 PM
  • 腾讯会议链接: https://meeting.tencent.com/dm/CkmP1ocpqAR1
  • 主讲人:贺强博士,中国农业科学院作物科学研究所博士后。2017年毕业于国立公州大学(韩国)植物资源专业。长期从事种质资源挖掘利用、生物信息等领域的研究。已在Nature Genetics, New Phytologist 等期刊发表SCI学术论文14篇。

中文摘要

基因组研究对作物群体遗传、功能基因组、育种应用具有重要意义。近年来随着测序技术和生信方法的快速发展,泛基因组、图基因组研究引起学界广泛关注。如何利用泛基因组、图基因组高效挖掘利用种质资源,对作物功能基因组研究和育种改良具有重要意义。本研究基于110个de novo组装的基因组,系统解析了谷子驯化改良过程,构建了谷子第一个高质量图基因组,并利用该图基因组对谷子68个性状226组表型进行了全基因关联分析和全基因组育种选择研究,在谷子图基因组辅助基因定位及育种应用方面取得重要进展,为谷子种质资源利用,功能基因组研究和精准育种提供了理论指导、基因资源和技术支撑。

参考文献

  1. He Q, Tang S, Zhi H, et al. A graph-based genome and pan-genome variation of the model plant Setaria[J]. Nature Genetics, 2023: 1-11.
  2. Li N, He Q, Wang J, et al. Super-pangenome analyses highlight genomic diversity and structural variation across wild and cultivated tomato species[J]. Nature Genetics, 2023, 55(5): 852-860.

关键词

  • 图泛基因组、种质资源、挖掘与应用
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