• 题目:人物专访 蒋宁教授:与跳跃基因共舞
  • 时间:2019 年 06 月 26 号(星期三),美西时间(Pacific Time)6:00 PM
  • 地点:YouTube live stream
  • 主讲人:蒋宁 (Ning Jiang) Professor of Department of Horticulture at Michigan State University Ph.D., Plant Biology, University of Georgia, 2002

中文摘要

二十世纪中期,Barbara McClintock 在玉米中首次发现了“跳跃基因”,为人类打开了认识植物基因组的一扇全新大门,并因此获得了1983年诺贝尔生理或医学奖。我们本期的专访嘉宾——蒋宁教授,对转座子研究领域也有着突出的贡献,让我们来听听她的故事。

蒋宁教授目前任职于密西根州立大学,多年来专注于转座子研究,在转座子类型鉴定、功能分析、进化方向等方面取得了诸多突破性进展。近期的研究成果有:利用LTR反转座子比例评价全基因组组装质量,转座子介导的宿主基因复制,Pack-MULEs表观遗传特性对染色体碱基组成和表达谱的影响等。

蒋宁教授发表的近百篇研究论文为我们讲述了一个个关于转座子的有趣故事,这些论文受到了学术界的广泛关注,总引用频次近万。她认为,相对于人类和其他哺乳动物,转座子在植物中非常活跃,是植物基因组研究领域无可争议的绝对热点。随着long reads sequencing、single cell sequencing等技术的发展,越来越多的高质量植物基因组被组装。我们可以预期,有关转座子在基因组进化中的作用,转座子跨物种功能研究等方面将会有越来越多的新故事被挖掘。蒋宁老师对此又有哪些新的见解呢?

这次人物专访,我们既想了解有关转座子的科学问题,也想听听她的人生阅历,关于平衡生活和工作的思考,以及如何做一个快乐的高产科研工作者。

近期发表文献

  1. Ou, S., Chen, J. and Jiang, N. (2018). Assessing genome assembly quality using the LTR Assembly Index (LAI). Nucleic Acids Research. 46(21):e126.

  2. Cerbin, S. and Jiang, N. (2018). Duplication of host genes by transposable elements. Current Opinion in Genetics & Development, 49:63–69.

  3. Zhao, D., Hamilton, J. P., Vaillancourt, B., Zhang, W., Eizenga, G. C., Cui, Y., Jiang, J., Buell, C. R., and Jiang, N. (2018). The unique epigenetic features of Pack-MULEs and their impact on chromosomal base composition and expression spectrum. Nucleic Acids Research, 46(5):2380-2397.

  4. Ou, S., and Jiang, N. (2018). LTR_retriever: A Highly Accurate and Sensitive Program for Identification of Long Terminal Repeat Retrotransposons. Plant Physiology, 176(2), 1410-1422.

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