• 题目:My experience of facilitating both hypothesis-driven and data-driven research as a bioinformatician
  • 时间:2018 年 09 月 05 号(星期三),美西时间(Pacific Time)6:00 PM
  • 地点:YouTube live stream
  • 主讲人:唐星 (Xing Tang) (BioMarin)

作为生物信息学家,经常遇到两种情况,第一种,生物学家根据明确的hypothesis设计实验,产生实验数据,本次报告我以一套single cell RNA-seq的数据分析为例,分享通过对数据进行QC控制,去除batch effect,降维处理等来回答生物学家已有的生物学问题。第二种情况是生物学家通过高通量实验手段产生了大量的数据,希望从数据中挖掘出新的知识和规律,这种情况需要借助数据整合分析平台,以我们的iGenomicsR为例,我将介绍如何使用它来实现多维组学数据(RNA-seq, DNA-seq, protein expression, clinical features)的整合分析,帮助生物学家找到新的病人分型,以及对应的致病基因或突变。

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